在打敗了地下通道中的狼形怪物後，大雄他們和偵查小隊繼續沿著通道深入。
通道內彌漫著一種壓抑的氣氛，牆壁上時不時閃爍著詭異的光芒，仿佛在訴說著古老的秘密。
“這裡感覺越來越陰森了，大家要小心。”靜香有些害怕地說道。
“彆怕，靜香，有我們在呢。”大雄安慰道。
胖虎則在一旁緊握拳頭，“哼，不管有什麼危險，我們都能克服，一定要找到那個實驗室。”
哆啦a夢一邊用探測器掃描周圍，一邊說“大家注意，探測器顯示這裡的能量波動很不穩定，可能還有其他未知的危險。”
他們走著走著，來到了一個岔路口，三條通道分彆通向不同的方向，每條通道都散發著神秘的氣息。
“我們該走哪條路呢？”偵查小隊隊長問道。
“我來看看。”哆啦a夢拿出一個方向探測儀，經過一番操作後，皺著眉頭說“奇怪，探測儀受到了乾擾，無法準確判斷哪條路是正確的。”
“那我們隻能分頭行動了。”真嗣說道。
“不行，這樣太危險了，我們不能分散。”大雄反對道。
就在大家猶豫不決的時候，他們聽到從中間的通道傳來一陣微弱的嗡嗡聲，聲音中似乎夾雜著一些類似機械運轉的聲音。
“我們走中間這條試試吧，說不定有線索。”渚薰提議。
大家點頭同意，朝著中間的通道前進。隨著他們的深入，通道越來越寬闊，周圍出現了一些巨大的齒輪和機械裝置，這些裝置看起來已經有些陳舊，但仍然在運轉著。
“這些機械裝置是做什麼用的呢？”胖虎好奇地看著周圍。
“不知道，但感覺它們和我們要找的實驗室有某種聯係。”哆啦a夢回答道。
突然，機械裝置開始加速運轉，發出巨大的轟鳴聲，齒輪之間摩擦出耀眼的火花。
“不好，大家小心！”大雄喊道。
話音未落，一些巨大的金屬臂從機械裝置中伸了出來，朝著他們揮舞過來。
“快躲開！”靜香驚叫道。
駕駛員們操控著eva機體躲避金屬臂的攻擊，同時尋找反擊的機會。
“我們得想辦法破壞這些機械裝置，不然我們會一直被攻擊。”真嗣說道。
“我發現了，這些機械裝置的核心動力源在那邊。”哆啦a夢指著一個被層層防護包裹著的發光球體說道。
“那我們集中攻擊那個動力源！”大雄喊道。
眾人朝著動力源發動攻擊，然而，防護層非常堅固，他們的攻擊隻能在防護層上留下一些淺淺的痕跡。
“這樣不行，我們的攻擊太分散了，得一起攻擊一個點。”渚薰說道。
於是，駕駛員們調整攻擊方向，集中火力攻擊防護層的一個點。在連續的攻擊下，防護層終於出現了一個小缺口。
“繼續攻擊，擴大缺口！”胖虎喊道。
經過大家的努力，缺口越來越大，動力源開始出現不穩定的跡象。
“再加把勁，它快不行了！”靜香喊道。
最終，動力源在一陣耀眼的光芒中爆炸，周圍的機械裝置也隨之停止了運轉。
“呼，終於搞定了。”胖虎鬆了一口氣。
“我們繼續前進吧，應該離實驗室不遠了。”大雄說道。
他們繼續沿著通道前進，不久後，前方出現了一道巨大的金屬門，門上刻滿了各種神秘的符號和圖案，和之前他們見過的符號相似。
“這裡應該就是實驗室的入口了。”哆啦a夢說道。
“可是這門怎麼打開呢？”靜香看著巨大的金屬門問道。
大家在門周圍尋找開門的方法，這時，大雄發現門旁邊有一個類似控製台的裝置，上麵有一些凹槽，凹槽的形狀和他們在神秘身影那裡發現的武器形狀相似。
“你們看，這個會不會是開門的機關？”大雄說道。
“有可能，我們試試把那些武器放上去。”哆啦a夢回答道。
他們把之前繳獲的神秘身影的武器插入凹槽，金屬門發出一陣低沉的轟鳴聲，緩緩打開。
門內是一個巨大的空間，裡麵擺滿了各種先進的儀器和巨大的容器，和大雄在與eva機體深度融合時看到的畫麵一模一樣。
“我們終於找到了。”胖虎興奮地說。
“這裡就是一切的源頭嗎？”真嗣看著周圍，滿臉震驚。
此時，明日香看著周圍的儀器，對綾波麗說“哼，這些奇怪的東西，看起來就不是什麼好東西，肯定是它們搞出了那些使徒。”
綾波麗微微點頭“嗯，我們得仔細找找線索。”
他們在實驗室裡四處查看，發現了一些實驗記錄和文件，文件中記載了一個可怕的計劃。原來，使徒是這個實驗室早期的實驗產物，目的是為了創造出一種超越人類的新生命形式，但實驗失控，使徒開始擁有了自己的意識，並對人類產生了威脅。而那些神秘身影則是實驗室的守護者，他們試圖阻止人類對使徒的研究，認為這是對自然秩序的破壞。
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“這……這太可怕了，這個計劃竟然引發了這麼大的災難。”靜香顫抖著聲音說道。
“我們得把這些文件帶回去，讓司令看看。”大雄說道。
就在他們準備收集文件的時候，實驗室裡突然響起了警報聲，燈光開始閃爍。
“不好，我們觸發了警報，可能有危險。”哆啦a夢說道。
突然，從實驗室的深處湧出一群小型的機械怪物，這些怪物外形像蜘蛛，行動迅速，朝著他們撲了過來。