一開始根本就想錯方向了，現在一切的事情都串聯起來了。
柯南直接跑回了監控室，一針直接迷暈了毛利小五郎。
本打算帶著庫拉索離開繼續去浪漫的神穀皆月，看的一愣一愣的。
間諜x不是已經被抓了嗎？
柯南還要破案？
難道還有間諜abcd？
神穀皆月駐足停留，想看看柯南到底要推理什麼東西。
原來柯南想要推理的是誰殺害了笹浦海尉。
神穀皆月這才恍然大悟，雖然神盾艦上抓住了間諜x，關西地區抓捕了和間諜x有關係的竹內，但是笹浦海尉這個出賣神盾艦資料的自衛官是怎麼死的還不清楚。
而且笹浦海尉也沒有被殺的理由。
經過柯南的推理，殺害笹浦海尉的是若狹警備課的倉田正明。
其實也不算是殺害，充其量也隻是過失致人死亡。
笹浦海尉根本就沒有登上過這艘神盾艦，他在舞鶴港的山崖上對著間諜x揮舞信號旗，在那兒之後就跌入海中身亡了。
手機出現在神盾艦上，就是倉田正明想要製造出笹浦海尉登上過神盾艦的假象。
笹浦海尉的手機第一個發現人是藤井七海，藤井七海拔出了記憶卡之後，因為毛利小五郎和目暮警官等人來到了甲板上後，因為匆忙，手機掉落在了甲板上的夾縫上。
神盾艦都已經起航了一段時間了，手機掉落的地點明明就非常明顯，卻沒有任何一個人發現手機。
說明手機是在啟航後，才被倉田正明刻意拿出來作為偽造的證據。
那麼凶手就是中途登上神盾艦的人，若狹警備課的倉田正明。
證據就是笹浦海尉中的語音留言，在語音留言之中，有金屬碰撞的聲音，這聲音是掛在腰間的特製警棍與手槍碰撞的聲音。
笹浦海尉的這通留言是早上5點半，死亡時間也同樣是5點半，所以笹浦海尉在舞鶴灣上揮旗通知間諜x之後馬上就死了。
而倉田正明是舞鶴灣發現的可疑船隻的第一發現人，時間也是在5點半左右。
當時巡邏的隻有倉田正明，那麼凶手就很明顯了，就是倉田正明。
倉田正明不再反駁，選擇認罪。
當時巡邏的時候倉田正明發現了可疑人員追了上去，而心虛的笹浦海尉拔腿就跑。
經過緊張刺激的你逃我追之後，笹浦海尉從山崖上跌落進入了海中。
然後倉田正明在尋找笹浦海尉的途中，發現了那艘可疑船隻。
倉田正明後來發現墜海的是笹浦海尉，雖然是過失，但是倉田正明還是很害怕，後來才會想著把手機放在神盾艦上，讓大家以為是笹浦海尉是在神盾艦上死亡，逃脫懲處。
倉田正明被警察帶走。
這時候鈴木園子帶著孩子們匆匆找了過來詢問道“叔叔，你們有看到小蘭嗎？我們到處找了很久都找不到她！”
柯南用毛利小五郎的聲音猜測道“說不定是迷路了吧？”
勇氣反駁道“才不是呢！大姐姐是跟間諜打鬥之後才發現不見的！”
同時佐藤警官急匆匆的走了過來“目暮警官，x的口供之中有一件事令人擔憂，他說在被逮捕之前真實身份不小心被一名高中生模樣，會使用空手道的女子識破，為了滅口，他把那個人扔進了海中。”
在場所有人頓時神情一變，神穀皆月的表情也瞬間變得陰沉了下來。