剛成為橘子群島榮譽訓練家的小智，再次和小霞以及小建登上了小型遊輪，踏上了前往其它島嶼的海洋之旅。
深海洋流的暴動首先導致了它所處海域的變化，平靜的海麵突然就變得波濤洶湧了起來。就連天氣都受到了影響，風暴悄然降臨，漆黑的雲中悶雷時不時的炸響。
原本乘船前往某一島嶼的小智一行人亦是處於被影響到的範圍中，小型遊輪的航向已經不受船長的控製了。
無數生活在大海中的寶可夢都浮出了水麵，隨著洶湧的大海與那艘小型遊輪一同被推動著前往了漩渦列島的方向。
海麵下，火箭隊笨蛋三人組所打造的鯉魚王外型的人力潛水艇被無數鯉魚王環繞著，同樣無法控製的衝向了漩渦列島。
在大海上漂流了一段時間，小型遊輪的船長看著眼前慢慢浮現的島嶼驚呼道“竟然被卷到這邊來了嗎？”
“啊？”小智站起來看了過去，“這座島嶼是……”
“亞西亞島。”船長回答了他的問題，“這座島嶼處於橘子群島海域的最邊際，它是歸屬於城都地區，被稱為漩渦列島的海外群島中的主島。”
整個世界都隨著火焰鳥的下線慢慢出現了變化，畢竟祂負責鎮壓的深海洋流和另外兩股洋流，一旦出現變故會影響到整個世界的大海。這，是足以導致世界末日的危機。
如果所有的深海洋流都開始暴動，並且沒有及時的阻止的話，這個世界估計用不了多久就會成為海底世界。
（蓋蓋還有這好事？不會飛你丫老老實實在豐緣地區待著就行，可彆滿世界創造陸地給我找事。）
那時候，除了水生的寶可夢之外，基本就沒有其它生靈的活路了。
但是，這危機可沒有那麼簡單。
等海底世界鑄成之後，緊接著就是所有深海火山的爆發，水生寶可夢們也隻剩下了成為水煮魚這最後的結局。
而且，所有的傳說中的寶可夢地盤都被磨滅了之後……恐怕除非阿爾宙斯親自降臨，不如僅僅靠著一個‘秩序之神’，恐怕是無法阻止所有神明共同掀起的神戰。
世界的變化最先出現在了關東地區和城都地區，這兩個地區是距離事發地點最近的兩個地區。這兩個地區是緊密挨著的鄰居，‘常青森林’可是橫跨了這兩大地區的巨型原始森林。如果不迷路的話，是能夠通過這座森林直接偷渡到隔壁地區的。
真新鎮，騎著自行車鍛煉身體的大木博士路過了小智的家，見花子正在澆花停下車子打起了招呼。
“喲小智的媽媽，這些花草都很有精神呐。”大木博士笑著說道，明明自己才是長輩，但每次見到花子的時候，大木博士都下意識的會把對方看作是自己的長輩。
（小智啊小智，你小子社交魅魔啊，穿越個時空都能把少年大木變成了好盆友。）
“啊，是大木博士啊。”花子轉過身來笑著回應道，“最近幾天的天氣一直都很好，花草們也就成長的很健康了。”
大木博士讚同的點了點頭，“是啊，這樣好的天氣，連我都忍不住暫時放下研究工作，出來活動筋骨了。”
話音剛落，一陣狂風吹拂而來，緊接著天空上就布滿了連綿的黑雲。
兩人都是一愣，沒等說些什麼大暴雨就頃刻而落，連一點反應的時間都沒給剛才還誇讚天氣的二人留出來。
魔牆人偶及時的拿出了雨傘給花子打著，而大木博士一瞬間就變成了落湯雞。剛想快點回去，暴雨就結束了。
“這是什麼情況啊？”大木博士抹了一把臉上的雨水，看著這異常的天氣很是心累。
“我也搞不清楚這是什麼情況……”花子看著天空中根本沒有散去的烏雲，也是丈二和尚摸不著頭腦。
下一刻，無數的雪花飄落。
“啊，下雪了！”花子驚喜的用手掌接著雪花，冰冰涼涼的觸感很是舒服。
“可是……”大木博士逐漸變得憂心忡忡了起來，“現在可是夏天啊，夏天怎麼會下這麼大的雪啊？”
魔牆人偶突然大叫著指向天空，兩人連忙抬頭看去，隻見原本隻會出現在極點的極光竟然出現在了這裡的天空中。
無數鳥型的寶可夢都驚慌失措的亂飛著，相互身為天敵的波波和烈雀這兩大種族竟然都沒有大打出手，而是同樣的哀鳴著。
鳥型寶可夢們剛飛遠，極光就和暴風雪一起消失了，耀眼的太陽又出現在高空中。
大木博士和花子大眼瞪小眼，半晌大木博士才說道“我們兩個一起出現了幻覺嗎？”說著，又從頭上拍下來了一些冰碴。
“波哩！”魔牆人偶又是一聲大叫，遠處無數陷入了暴動的地鼠冒出了地麵，瘋狂的往它處逃遁。大木博士及時的跳下了自行車，心疼的看著自己的車子被地鼠們卷走。
魔牆人偶也開始出現了驚慌的情緒，它也感知到了，即將來到的災難。
“魔魔，你怎麼了啊？”花子擔心的看向魔牆人偶，又是連忙向見多識廣的大木博士詢問道“大木博士，是不是發生了什麼大事了啊？”
“嗯，一定是發生了一些了不得的大事……這個大自然中一定是發生了大事。”大目木博士看著晴朗的天空，好心情全部消失無蹤了。
“大自然還有很多事情是人類不曾了解過的，而寶可夢們，遠遠要比人類敏感的多啊……”大木博士隱約猜到了原因，恐怕自然突然發生的劇變，又是因為有心思不正的家夥對神明出手了。
上一次他見到類似的場景，還是四五十年前，雪拉比被邪惡組織乾部比夏斯控製之後，引起的常青森林劇變。
身為森林之神的雪拉比，以枯萎的巨樹所織就的神軀，給年少時的大木博士留下了不可磨滅的記憶。
如果不是進行了時間旅行的小夜和小智拚儘全力拯救了雪拉比，現如今這個世界上還有沒有常青森林都不一定呢。
‘希望，這一次也能有優秀的訓練家可以向神明伸出援手，並且平息神明們的憤怒吧……’大木博士歎了一口氣，對部分人類貪婪的心性變得更加厭惡。
‘聽，樹在哭泣。’世界樹上，雪拉比哀傷的看著夢幻說道。
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