廟宇高三層，整棟通高和第一層麵闊均約十米左右，越上層麵積越遞減。
內牆與天花板紋飾及三尊主要供像的腰布彩繪具有極高的藝術成就。
大殿入口是一個木質門廊，曆經千年，不倒不朽。
木質門廊的柱頭形製，來自古代希臘石雕門柱，但有所簡化，已經演變成經典的藏式建築木柱。
木質橫梁間有三個三角形框，每個裡麵都有一尊健陀羅風格的佛像。
大殿一層，入口處繪有壁畫。
左下側脅侍頭戴骷髏冠，左手奉嘎巴拉碗，右手持劍。
右下側脅侍身披孔雀羽鬥篷，右手持金剛杵，左手奉嘎巴拉碗。
該殿第一層西壁、東壁和北壁各開一大型佛龕，分彆供奉觀音、文殊及彌勒菩薩立像。
根據彌勒菩薩足側的題記，此三尊依次代表密教要義之身、語、意三業。
周圍牆壁上密布著精美的圖案，包括佛像、曼荼羅、人物、動物、花卉等等。
觀音和文殊皆高四米左右，彌勒高有五米，頭部和龕頂延伸至第二層。
三尊像均為四臂，各結印相，戴高聳寶冠，身飾瓔珞，下身彩繪腰布，各以其特定主題描繪種種圖景，構圖精麗細致，極具特色。
觀音菩薩腰布上分布佛教寺院，印度禪殿，宮殿民房等世間建築，共十四座，並有佛、菩薩、神祗像及社會各階層人物躍然其間，似代表觀音慈悲救度迷悟眾生。
彌勒菩薩腰布密布排列規整的圓輪，內六十餘幅佛傳圖，內容偏重佛陀成道前之事跡。
另有，其為菩薩時住於兜率天的景象。
從彌勒為未來佛和彩圖題材推測，這些圖像應為表現彌勒當來下生，一如釋迦牟尼佛般成道度眾。
文殊菩薩腰布主要描八十六尊大成就者像，代表菩薩之大智慧。
構圖以無數七彩小方格，對角排列，劃分出八十五個區塊，內繪或單獨或有伴之大成就者。
另於文殊股間下繪製有一身形較大的坐像，當為那洛巴尊者。
諸像身形，姿態迥然不同。
東西北三壁龕外兩側壁和南壁繪製佛、菩薩像，總計能計逾三千尊。
包括西壁八百一十四尊阿彌陀佛坐像，東壁七百二十八尊文殊菩薩坐像，北壁七百一十二尊阿閦佛坐像及南壁一千零六十三尊阿閦佛坐像，儼然為壯麗的千佛化境。
共有五尊綠度母像。
中央主尊相對尺寸較大，餘四尊上下對稱列於兩側。
主尊六臂，下裳綴飾弓箭手及交疊的動物圖像，華麗非常。
三右手分彆持念珠、金剛戟及作與願印。
左手則執經卷、寶瓶和結印，趺坐蓮座。
身側各有一藍色長莖蓮花，身後以一巨大圓輪襯托其形象大致與《成就法鬘》中所相同。
主尊頭部微側，側向的眼睛凸出臉部輪廓外，很有特色。
此壁畫構圖，似寓意佛的報、化、法三身。
左下右下方，度母現凡人相，可能代表佛的報身，度化眾生。
左上與右上方，度母呈超凡的多臂造型，或代表佛的化身，能隨應眾生現種種形。
六臂主尊則代表佛的法身，具足一切善法。
畫麵左側男子蓄須，戴紅帽，著黃袍。
右側女子呈貴族裝扮或為皇後，穿紅袍，披白色鬥篷，手持珠鏈及珍寶，作供養狀。
此二人緊鄰主尊，可能為此圖供養人或三層堂建築之功德主。
圖左上方與右上方的四臂綠度母，一跣足立於蓮台，一跏趺而坐，各戴華冠，身飾瓔珞，皆持相同法器，印相。
左下方與右下方綠度母寶冠華美，衣飾繁複，身形婀娜呈立姿，轉臉俯視須彌座上之男女供養人。
佛帶蓮瓣形頭光及背光。
頭光內緣飾彩珠，背光內圈邊緣紋飾似小型燭火，整齊排列。
發髻圓凸，眉間現白毫，雙眼長，嘴小微抿，下頜豐滿，麵相中見清秀。
著通肩袈裟，賦以紅、藍、白等色，間綴碎花，肩披珠串，長垂過膝。
右手當胸施無畏印，左手自然垂下，足掌外展而立，背景為寺院建築，高聳之層層錐形屋頂，具喀什米爾建築風格。
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