伽休萊因被消滅後，藤樹返回鳳凰巢基地。
與希卡利商討了一下有關阿古茹和蓋亞的事情。
如今藤宮和我夢之間的默契不夠，想要在短時間內實現融合變身，隻能借助外力。
藤樹想著能不能讓希卡利開發出一款幫助他們變身的道具，畢竟希卡利對大地之光和海洋之光都有一定研究。
希卡利表示可以嘗試一下，但最後接下這個任務的，是霧崎。
霧崎想要借著這個機會積累對光芒的研究經驗，如果能夠成功開發出融合蓋亞與阿古茹的道具，接下來開發讓自己變強的道具也能更加得心應手。
蓋亞宇宙那邊。
克裡西斯的消亡被根源性破滅招來體察覺到。
雖然不知道地球上具體發生了什麼，但他們也意識到了一絲不對。
向地球派出美紮德進行探查，搜集地球上的情報。
雖然被阿古茹和蓋亞聯手消滅，不過也得知了蓋亞與阿古茹並肩作戰甚至已經變得更強的消息。
同時，自然控製機器天界也在此時蘇醒，準備淨化大氣，並清掃地表上的一切。
最終被xig控製住，並在藤宮的建議下收容起來，如果對其加以改造，調小功率，說不定能變成一個單純淨化空氣的機器。
不過，這種早已隱藏在地球內部，並用來淨化大氣的機器究竟是誰研究出來的，成了一個謎。
根源性破滅招來體方麵。
他們原本的計劃是讓兩位奧特曼內鬥，一方麵牽製地球的戰力，另一方麵是為了借助兩個奧特曼戰鬥時產生的能量製造蟲洞，從而向地球派出強大的兵力。
如今兩位奧特曼提前消除隔閡，不會再發生內鬥的情況讓他們深感可惜。
不過，由於宇宙間的融合現象導致空間變得脆弱，根源性破滅招來體不需要借助奧特曼的能量就已經能製造足夠範圍的蟲洞。
麵對聯手的蓋亞與阿古茹，根源性破滅招來體準備讓他們見識一下什麼叫做真正的侵略。
接下來，根源性破滅招來體會對地球發起更大規模的進攻。
徹底將地球上的所有文明抹除。
夢比優斯宇宙這邊。
地球外。
漆黑的宇宙中。
一艘特製的寬大宇宙飛船已經來到太陽係內。
飛船內，是率先趕到這邊的，黑暗皇帝安培拉星人手下的尖兵，黑暗四天王之三。
謀將·帝斯雷姆。
豪將·格羅紮姆。
智將·美菲拉斯星人。
原本身為黑暗四天王之邪將的邪惡博伽茹被黑暗皇帝封印，導致邪將位置短暫空缺。
不過現在。
又有一位新人加入。
一道黑煙飄入這艘飛船內部，在煙霧繚繞的陰暗空間內，彙聚成渾身布滿尖刺的紅色身影。
見此。
“這不是大名鼎鼎的亞波人嗎~”格羅紮姆認出對方的身份，揶揄道。
作為能夠製造超獸的異次元種族，亞波人的名聲在宇宙間的知名度不低。
不過通常與亞波人一起出現的，還有另一個名字，艾斯奧特曼。
原本準備侵略地球的亞波人在與艾斯的戰鬥中，屢戰屢敗，被迫從一個種族融合成了一個個體，接著，屢敗屢戰。