重生之神奇寶貝世界！
大木博士看向四周的幻影神奇寶貝，一臉溫和道“確實所有的神奇寶貝們都有不同的屬性、長處和短處，但這並不是你所說的缺陷，而是個性！”
“即使在同種類的神奇寶貝之間，也會有他們個性上的差異，摧毀他們的個體特征，這個想法真是不可理喻。”
“神奇寶貝們是存在大自然中的生物，甚至可以說是他們代表了自然，你絕不可以破壞這種平衡。”大木博士一陣慷慨激昂的講話。小炫自顧自的鼓掌叫好，不過眼睛一直看著夢幻。
夢幻察覺到了小炫的目光，衝小炫笑了笑。
小炫一驚，這隻夢幻有自己的意識，真是神奇。
“不愧是大木博士，真是一場有趣的神奇寶貝講座啊！”主謀者感歎。
“但是，在你聽過我絕妙的計劃之後，也許會改變想法的。”主謀者對著控製台一陣操作。
一個巨大的玻璃罩中，閃過白光，仿佛要出現什麼東西。
“這是…”大木博士不確定。
另一邊，小智和小霞成功潛入城堡，遇到了火箭隊，真是人生何處不相逢。
小智一行人身影出現在實驗室的屏幕上。
“小智、小霞！”大木擔心道。
“果然還是來了，讓我好好利用吧。”主謀者操作裝置，幻影神奇寶貝都消失了，夢幻的身影沒有了遮擋物，出現在了麵前。
“你又出現了啊！”主謀者好像早就知道夢幻的存在。
“難道…你是夢幻，是夢幻吧！”大木博士驚訝。
夢幻飛到大木博士身邊，來回轉悠，好像在表示友好。
“初次見麵，我是大木。”大木博士向夢幻打招呼。
突然，一道雷電擊中夢幻，夢幻倒在地上。
“啊！夢幻！”大木博士擔心道。
小炫急忙抱起地上的夢幻，怒道“你怎麼可以這樣對待他！”
“你乾嘛突然下手這麼狠！”大木博士怒道。
“這與你們無關，那夢幻純粹是一件失敗品，立刻給我消失。”主謀者看向夢幻。
在小炫懷中的夢幻，掙脫了小炫的懷抱，看了眾人一眼就離開了。
“夢幻！”
屏幕中，火箭隊被打飛，小智和小霞被幻影神奇寶貝抓住。
在押運的過程中，兩人都逃走了，隻有皮卡丘被捉了回來。
皮卡丘被放在一個儀器上麵，主謀者一陣操作。
“幻影的主謀者，你要對皮卡丘做什麼！”
“我正在從皮卡丘的記憶中取出神奇寶貝的資料，既然你不願意將數據給我。”主謀者摸了摸裝皮卡丘的儀器。
小智一行人救到了大木博士和小炫，眾人逃離了城堡。
主謀者也追了出來，幻影超夢跟著。
眾人感到壓力山大，幻影超夢的實力太強大了，根本沒有贏的可能。
其實山梨研究所的密碼是山梨博士給小炫的，山梨博士有意讓小炫繼承他的衣缽，可是小炫乾著乾著就走人了，這件事就不了了之。
小炫看著榮格博士與超夢，平靜的說“榮格博士，你知道我為什麼會給你山梨博士數據庫的密碼嗎？”
“哦，為什麼？”勝券在握的榮格博士，對於小炫的話起了興趣。
“其實，我一開始就覺得你不對勁了，不過我想看看你究竟在做什麼，能做到什麼地步，可惜沒有達到我想要的結果。”小炫一臉高深莫測。
“現在，這場鬨劇該結束了。”
“路卡利歐！”小炫大喊。場麵瞬間寂靜無聲，小炫尷尬萬分，如果頭頂上再有幾隻烏鴉，小炫都沒臉見人了。
“轟！”城堡中發出驚天巨響。
最後一係列事情之後，幻影裝置被破壞，整個城堡一片大火，榮格博士消失在大火中。
在茵鬱市擊敗了茵鬱道館的娜琪，獲得了白羽徽章。打敗了之後一路挑戰了道館與華麗大賽，除了對戰四天王的源治，爆發出極限力量，除了沙奈朵沒上，其他的三隻都上了，之後的小炫機緣巧合下獲得了一隻火稚雞，終於湊齊了向芳緣聯盟挑戰的六隻神奇寶貝。
小炫繼續旅行，然後參加了兩次華麗大賽，獲得兩枚緞帶勳章，可以參加華麗大型慶典。
在華麗大型慶典上險勝羅伯特，成為了頂尖協調訓練家。
在彩幽大會中，一路奮戰，不斷戰鬥，擊敗哲也，拿到了冠軍