隨著尚可喜大軍的潰敗，洪承疇完全失去了在荊江上阻截大順軍的能力。
而此時荊州城已經被荊江水包圍，陸軍無法抵達，洪承疇隻能眼睜睜看著李自成率大軍救援荊州。
不過，此時的荊州城內已經成了人間煉獄。
城中的瘟疫已經擴散開來，荊州城幾十萬軍民已經有十分之一的人病倒在地。
明朝末年，天災人禍不斷，大順軍中也出現過瘟疫，李過懂得一些基礎的防治瘟疫的辦法。
不過，此時的荊州城中缺醫少藥，很難救治患者，隻能采用最簡易的隔離方法，防止瘟疫進一步傳播。
李過在城牆上和城中的房屋內，開辟出了專門放置患病軍民的區域。
並且派出士兵把守，外人不得靠近，每日派專人去給這些患病的軍民送飯。
同時，李過也下令，對於經常接觸病患的士兵，必須要用布遮住口鼻，防止自己也受到感染。
但是，這依然不能完全阻斷瘟疫在城中的傳播。
依然會有口渴至極的百姓和士兵冒著生命的危險偷喝江水。
另外，每日負責看守和照料病患的士兵也會攜帶有瘟疫病毒，也在不斷將病毒傳播給其他健康的軍民。
荊州城中，每日都有大量的百姓和士兵死亡。
而這些死亡軍民的屍體又十分難以處理，將屍體繼續留在城牆或者屋裡必然會腐爛，傳染更多的人，現在城中又沒有土地來掩埋屍體。
李過隻能命人將這些人的屍體重新拋回道江水中，這使得城中江水的感染、致病性更強。
就在荊州城到了最危難之時，李自成終於率領大軍趕到。
荊江已經改道，江水繞荊州城而過，不過城牆周圍吃水深度達幾米深的大型戰船並無法抵達，李自成隻能命大軍換乘了小型民船，來到了荊州城下。
此時的荊州城牆上，仍有大順士兵正在向外了望，期盼著援軍的到來。
看到城外有船隻過來，並且認出是己方的士兵後，城牆上的守軍發出了一陣歡呼。
援軍抵達的消息傳遍了全城。
然而，站在船頭的李自成卻發現了城中的異常，守城士兵死氣沉沉並無一點活力，並且一些士兵還用破布遮住了口鼻。
他心裡暗叫一聲不好，連忙向士兵發問，“當前城中情況如何？”
領頭的小校聽到李自成的詢問，帶著哭腔回答道“陛下，城中缺糧少水，而且正在鬨瘟疫，死了很多人。”
瘟疫！
李自成最害怕的情況還是發生了！
他知道古代醫療條件太差，防治瘟疫隻能靠隔離，根本無法治療。
隻能等感染瘟疫病菌的宿主全部死亡後，瘟疫自行消散。
此時，城門處的幾名守兵，一頭紮進了渾濁的江水裡想要打開城門迎接李自成大軍進城。
李自成向著城上大聲喝道“不要打開城門！叫補之將軍過來見朕。”