可殺戮才開始，法正、賈詡根據供述，一條條命令從成都太守府傳出，每一條命令就是幾十條生命，甚至幾百上千條人命。
清洗不可避免，反叛一開始就知道要承受這樣的結果。所有參加叛亂者斬殺滅門，家庭財產、田地全部充公。
首犯黃元、彭羕、雍茂、龐樂、李異夷九族，所在家族直係族人全部斬殺，旁係族人全部服勞役，修直道，挖礦十年，十年後流放交州屯田。
黃家、李家、張家、元家等八大世家家主夷九族，族內直接參與反叛者夷三族。
所有族內直係全部斬殺，牽連的族人服勞役，修直道、挖礦十年，十年後流放朱崖洲。
凡是被舉報參與叛亂者，經查證全部斬殺滅門，家族人員流放南州。
經舉報查證，雖未直接叛亂，卻過各種資助的世家達二十三家之多，占益州世家十之六七。
成都清理叛亂血流飄杵，一天一夜戒嚴，家家關門閉戶。
成都叛亂當晚，隻要出來參與過，就是叛亂者，全部就地斬殺。
益州其他郡受叛亂牽連的也遭到了清洗，益州一時噤若寒蟬，聞叛色變。
等到諸葛亮從蜀南平叛勝利回到成都才作罷。
許靖因不作為，罷免郡守之職，遷豫章郡贛縣為縣丞。
諸葛亮讓諸葛謹匆匆從合肥趕到成都，任益州刺史，全權管理益州行政事務。
調任張紘為成都太守，協助諸葛謹治理成都，調劉虎為成都都尉以鎮守成都。
隨著諸葛謹而來的，還有揚州屯田常備軍15萬人馬，他們的家屬也隨遷，駐紮在益州各處為軍屯，成為益州防備新力量。
甘寧也是第一時間趕回成都，協助諸葛謹穩定局勢。
吳懿及平叛的幾萬成都城衛軍，調往江夏，吳懿任江夏郡太守。
在成都殺得人頭滾滾的邢道榮、沙摩柯、張飛所領諸軍，包括李架司馬的屯田軍及嚴顏等人，全部調往荊州駐紮在襄樊。
楊洪升為益郡太守、振威將軍；陳曶、鄭綽升為偏將軍率軍調漢中。
劉闔任漢嘉郡太守，接替因病醫治無效而死去的費觀。
法正、龐羲、程畿、鄧芝、董允都跟著諸葛亮去了襄陽。
賈詡他們當然是第一批回荊州襄陽的平叛人員。
諸葛亮將參與了成都平叛的人與軍隊全部調離，一方麵是為了益州的安定。
同時也是為了保護在成都平叛的諸位將臣士兵，還獎賞他們大量的錢財與田地。
經過這次的平叛與清洗，益州成為了新益州，諸葛謹漸漸地引入揚州的屯田政策，將益州完全由世家統治的世界，改造成了屯田客為主的新益州。
同時，成都收歸公有的土地，為蜀南的少數民族及夷人，遷來成都及益州，留足了空間。