現在，隨著宇智波帝國領土麵積的不斷擴張，原本有些簡陋的帝國高層部門，也漸漸細化規矩起來。
這使得帝國的治理變得更加有序和高效。
聖一並沒有過多地費腦筋去思考如何建立新的部門體係，而是選擇了一種簡單而有效的方法——直接照搬前世的六部製度。
這種製度在前世已經被證明是非常成功的，可以有效地管理宇智波帝國的各個方麵。
吏部，負責管理文職官員的選拔、任命、考核和升遷等事務。
這個部門由波風水門擔任部長，他以其出色的領導能力和公正無私的品質贏得了人們的信任。
宇智波焱刃則擔任副部長，協助波風水門處理日常事務。
戶部，負責管理帝國的財政、稅收、戶籍和土地等事務。
這個部門的重要性不言而喻，因為它關係到帝國的經濟穩定和發展。
奈良鹿久被任命為部長，他以其卓越的理財能力和謹慎的性格，確保了帝國的財政安全。
原宇智波財務長老，宇智波鋼木則擔任副部長，與奈良鹿久一起共同管理帝國的財務。
禮部，負責管理帝國的禮儀、祭祀、外交和教育等事務。
這個部門不僅需要具備文化素養和外交智慧，還需要有良好的組織能力和協調能力。
綱手姬被任命為部長，她以其強大的實力和果斷的決策能力，成為了這個部門的核心人物。
原宇智波外交長老，宇智波星則擔任副部長，協助綱手姬處理各項事務。
兵部，負責管理帝國的軍事、國防和武官的選拔、任命等事務。
這個部門是帝國的安全保障，需要有高度的戰略眼光和軍事才能。
宇智波止水被任命為部長，他以其卓越的戰鬥能力和敏銳的洞察力，成為了這個部門的領袖。
宇智波幕則擔任副部長，協助宇智波止水管理軍隊。
刑部，作為一個重要的部門，其職責涵蓋了帝國的法律、司法和刑罰等關鍵領域。
這個部門的領導者是宇智波富嶽，而山中亥一則擔任副部長一職。
他們共同致力於維護帝國的法律秩序，並確保公正的審判得以執行。
與此同時，工部也扮演著不可或缺的角色。
它負責管理帝國的工程、建設和水利等事務，這些工作對於帝國的發展至關重要。
日向日足出任部長，而木遁·大和則擔任副部長，兩人攜手合作，推動帝國的基礎設施建設。
除了上述六部外，還有三科獨立於六部之外，直接受聖一管轄並對他負責。
其中包括情報科、暗殺科和研發科。
原有的暗部被細分為情報科和暗殺科，以更好地適應新的體製。
情報科由旗木卡卡西負責，他將帶領團隊收集和分析各種情報，為帝國決策有力支持。
暗殺科則由宇智波雷鳴領導，負責執行特殊任務，保障帝國的安全。