趙構獲得士族的支持後，馬上采取了行動，他下旨招幾個參加屠殺的高級將領到臨安來自辯。他叫的幾個人，都是跟秦檜關係密切的。那幾個人覺得有秦相在，他們也是奉命行事，沒有問題，不過為了安全起見，他們還是多帶了一些護衛，然後就大搖大擺來到臨安城了。
他們進臨安城的時候，並沒有人管，這讓他們更加放心。而護衛們現在都分到了一些劫掠得來的錢，很想在臨安好好玩玩，很快都跑的滿城都是。
那幾個將領被皇帝召見，一進宮門就被抓了起來。接著趙構下令關閉城門，在臨安城裡搜捕這次來的西軍。
與此同時，趙構調動其他軍隊，還有一些世家控製的武裝包圍了參與屠殺的西軍，解除了武裝。但趙構為了防止江南士族趁機把西軍一窩端，非常雞賊以防止兵變為名，提出隻誅首惡不計協從，隻抓了一些高級軍官，還趁機清洗了不聽話的一些西軍將領。
至於中下級軍官和士兵，趙構親自去安撫，所到之處西軍全部跪倒，都高呼“官家萬歲！皇上聖明！”他成功利用這次事件清洗了秦派將領，重新掌握了大部分西軍。
秦檜萬萬沒有想到最後會發展成這樣，他千算萬算也沒有算到西軍會如此暴虐引起了公憤，而範浚陸遊等人成功地利用他和官家的矛盾，將士族的矛頭引向他。憂急之下，他病倒了，比原來的曆史上提前了接近半年。趙構趁機收回了很多權利，現在暫時既當皇帝又當宰相。
完全控製京城後，趙構宣布為了體恤老臣，他將親自去秦檜家探視病情。在此之前出動了很多軍隊，士兵從皇宮一直排到相府，秦府的家丁全都繳械被趕到一旁。秦熺帶著一家老小在門口等了兩個多時辰，趙構才姍姍來遲。
然後他宣布，皇恩浩蕩，加封秦檜為建康郡王。秦檜自然要謝恩，於是有人把他從床上拖下來，放到趙構麵前，行跪拜大禮，然後舞蹈謝恩。趙構又宣布秦檜應該遊街誇官亮職。太監們給秦檜抬胳膊搬腿，穿上王袍，拽到馬上，打起儀仗，到禦街轉了一圈。一番折騰之後，秦檜已經進的氣不如出的多了。
然後趙構又讓已經上氣不接下氣的秦檜坐在自己麵前，語重心長地對秦檜說，很多人說秦檜是金國間諜，他是從來都不相信的；還有人說秦檜貪汙腐敗專用拍馬溜須之輩，他也是堅決不相信的；還有人說秦檜有操莽之心，他更是堅決不相信的。
眼看秦檜坐不住要半躺在太師椅上，趙構一把拉著他的手，讓他坐直，大講三十年君臣之誼。說到動情處，影帝趙構眼淚都下來了。而影相秦檜由於身體和精神的原因，完全不在狀態，“無一語，隻流淚而已。”
即便如此，秦熺還不服輸，不甘心放棄宰相夢，派秦塤同親信林一飛、鄭木冉見台諫官徐喜、張扶，並聯絡熟悉的將領，策劃自己的拜相事宜。但還沒來得及行動，已經回宮的趙構又在朝堂上宣布進秦熺為少師，為了讓老太師秦檜養病，讓秦熺侍奉床前儘孝心，恩準他爺倆都退休致仕。滿朝文武都稱頌官家對秦家父子皇恩浩蕩，秦熺孝感天地，無一人提出異議。秦氏父子這才死了心。
當晚經不起精神和肉體折磨的秦檜就死了。原本曆史上他還可以多活半年，高王二人穿越的小蝴蝶翅膀扇動帶來的改變，讓他提前死了。趙構假惺惺的追贈他為申王，諡號忠獻。這種不花錢，沒實權的稱號，趙構還是願意給的。他隻不過覺得秦檜當政二十年，門生故吏眾多，樹大根深，要鏟除還需要慢慢來。
至於王高謀反案，查無實據。吳益和王繼先找人控告王文修王忠義為賴賬殺死王七六一家六口。大理寺一開始還沒體會到秦檜已死，秦家已經倒台，就判王忠義貪匿貨款，欺騙王文修，大辟。王文修被蒙蔽，罰銀三千兩。
但趙構抓住不放，他早就對王文修他父親和叔叔都投降金國非常不滿，而且要讓世人都知道秦家完了，一定要拿王文修開刀。但鑒於王文修有散官的官職，根據宋朝不殺士大夫的原則，最後定了一個王文修縱奴行凶事後隱匿，誣告他人謀反，奪人財產，將其發配嶺南。
最後給王有誌定的罪名是驕橫不法，與民爭利。這個罪名有點滑稽，因為阜康商號本來就是民，王有誌也不算正經官員。雖然罪名荒唐，但通緝令被取消了，罰沒全部家產。高全的罪名居然是擅離職守，看來官家認為他是個頭腦簡單的武將，可以爭取。
不過有意思的是，他倆的官職卻保留了下來。這是吳益爭取來的，自從王有誌走後，吳益的公務再無寸進。他非常想念王有誌在的時候，他不但天天有進項，還月月有政績。
接下來就是最重要的錢的問題。西軍將領劫掠的財富，自然會收歸國庫。阜康商號的田地被周圍的士族瓜分。吳益宣稱阜康的資產大部分是他和王繼先的，證據是王繼先偽造的一份委托王有誌代持股份合約。他倆接受了兄弟解庫成為最大贏家。果然是“什麼你的我的，都是老爺的！”
阜康的大部分工廠被西軍焚毀，隻剩下一些礦山和幾個工廠的殘餘車間可以恢複，但吳益和王繼先不會經營，也找不到能經營的人，甚至賣都沒人買，因為配件也是阜康自己生產的，彆人買了也無法修理。結果剩餘這部分資產也陸續倒閉。
他開始越來越懷念王有誌了，不過自從澗溪溝戰役後，高王二人連同他們“上萬人”的隊伍就好像人間蒸發了一樣。吳益等人到處尋找，張貼布告，勸他們回來，都沒有音信。範海等人都認為高王應該是逃回澳洲了，隻有王翠喜堅信王有誌還會回來。
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