順治二年他就來過南方，坐鎮江寧儘力的和緩因為削發令而導致的民族之間的矛盾，但是那個時候的他的權力太小了，八旗更是指揮不動，隻能指揮大概101novel.com00人的隊伍。但就是這樣他也處死了不少大明的忠義之士，讓天下人好一頓罵。
順治四年的時候，洪承疇要回鄉丁憂，父母去世，朝廷有規定父母去世必須要回家守孝三年，如果你不去朝廷就不再用你了，彆說我這馬上科長升處長了，結果一個丁憂讓彆人上了，就是這樣你也得回去丁憂去，但是就隻丁憂了一年就讓多爾袞給召回了。但是召回之後並沒有給他重要的差事，而且發現了隨著漢人入京當官，滿漢的民族矛盾已經越來越大，不光是在江南就是在北京就在的金鑾殿上也是矛盾重重，主要原因就是滿漢的的不平等，滿人的官比漢人的官的待遇好很多，並且由於漢軍的數量和地位也在提高。順治皇帝也不得不改變，其中順治皇帝走出的重要一步就是選出了素有德望的洪承疇去支撐湖南局勢，為什麼選擇他呢，一方麵是他對南方非常了解，一方麵是自打洪承疇投降清朝以來他從不參與派係之間的鬥爭，隻是做好自己的事情，這在順治皇帝看來就非常好，也敢用他，於是派他去經略五省，封的官不得了是太保兼太子太師，內翰林國史院史院大學士，兵部尚書，兼都察院右副都禦史，可以彈劾百官，讓他經略湖廣，廣東，廣西，雲南，貴州總督軍務監理糧餉。這一次的權力可以說是很牛了，規定所有的軍政行動你說的算，完事之後跟朝廷說一聲就行了。特彆是可以領導八旗的裡麵的都統，總兵，包括親貴和將軍也一樣，不聽他的就砍頭，這次的經略範圍為西南五省之地，各地的總督，巡撫，提督，總兵的升遷調動也是聽他的號令，文官五品以下，武將副將以下可以先斬後奏，並且告訴兵部和吏部洪承疇要的東西必須不打折扣的完成。看看洪承疇的權力可以說是大清朝有史以來權力最大的漢官，重要的是那個漢字。這是因為順治皇帝非常信任他。
順治六年，濟爾哈朗奉命南下，其實就是多爾袞留著他的親王銜讓他去打仗的，這家夥可倒好，到了湖南大肆燒殺搶掠。光在湘潭就是毛主席的老家殺人就殺了一個星期。孔有德的軍隊從湖南進廣東，當地的老百姓已經餓的是皮包骨了不但要交糧還要為清軍運送糧草，老百姓真是沒活路了，那沒活路咋辦，造反唄。所以李定國反撲湖南，再加上綠營兵不少反叛的，所以南方小朝廷再次對湖南進行了控製，清朝也發現了這樣不行，現在是地位不穩民心沒有。所以清朝覺得靠著多鐸那種揚州十日，嘉定三屠這種肯定不是不行，於是不得不啟用對於南方非常了解的並且坐了好幾年冷板凳的大將洪承疇出山。
洪承疇經略南方期間就建立了非常大的長沙幕府，這是必須要的一個機構，他的方針是招撫為主，軍事為輔，他在南方就積極讓士紳加入，因為他知道湖南人心不定的根本就是士紳階層不支持，招撫他們就可以穩定人心，於是他開始走訪各地，平反冤假錯案，並且還廣招賢良，在他的一頓操作之下士紳歸順了。湖南地區日漸穩定，其中很有名的一個事情就是當時湖南官府抓到了很多反清複明的士紳，按照律法來說這些肯定都是得處死，但是洪承疇聽到這個事情覺得這是個好機會，直接審理這個案件最後所有的被告全部無罪釋放，原告被他給斬了，這般處理的結果，讓他就把湖南士紳的民心全部就收服了，並且當順治皇帝知道這件事情之後也表示洪尚書做得對。但是這是特殊情況他可以這麼做，如果放在了平常你連問都不問就因為他們是士紳你就這般跪舔老百姓不造反才怪。他之前剿匪的時候就是這樣不管是老百姓還是匪軍是一律殺光。
這件事情之後好多湖南和周邊的士紳就進到了長沙幕府為清廷效力，這就是高手在處理問題的方式，他不處理問題直接讓問題消失了，你不是士紳都要造反都不聽朝廷的嗎，那好你來為我做事這些不就都解決了嗎。洪承疇經略五省，讓破敗的五省又煥發了勃勃生機。
但是就是當時這麼大的一個大官他的晚年可過得不是很好，首先是他的家裡人老媽不認可他，他當了大官之後想接老媽來到京城享福，但是他媽來了就給他一巴掌說我都這麼大了還要來當老媽子，因為當時的大清律是官員的母親要去伺候太後的，他媽當然不願意於是就回了福建老家了。並且跟他的弟弟住在了船上意思就是說我不踩你大清的天，不踏你大清的地。1661年就是順治十八年，洪承疇以自己體弱多病為由請求退休，得到了批準。
雖然清廷也承認他的勞苦功高，是滿清入關的引路人，但是這個時候的天下早已經太平，誰還會記得當年他身處怎麼樣的情況呢？隻知道他是一個賣主求榮的小人，他也失去了作為一個漢奸的價值，最後隻給了他一個三等輕車都尉的爵位，相比同時期的平西王吳三桂那真是差了不是一點半點。其實他曾經還是吳三桂的上司。
最後到乾隆帝的時候，為了給大臣樹立良好的形象宣揚他忠君愛國的思想，於是又想起了他，把他列入了貳臣傳，成為了反麵教材的第一人。
可見沒有氣節的臣子，就是功勞再多再大，人們也是看不起他的。
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