時間悄然流逝。
在2161～2190年期間。
露娜救起有著相同的被遺棄遭遇的羅蘭，給了羅蘭暗淡無光的人生中第一束光，在羅蘭的堅持下他成為升格者的一員，從此宣誓追隨露娜一生。
居住於015號城市的，環大西洋經濟共同體的商業領袖科波菲爾先生與他的女兒艾瑪獲得在空中花園生活的機會，在登機之前，他給管家裡昂下達了保護莊園的最後一條命令。
“檔案”完成，拉斯特麗絲複現帕彌什病毒出現失敗，但觀測到病毒被吸收，她將這套吸收病毒的技術命名為“檔案”。留下影像後前往塔頂，亞特蘭蒂斯的最後一人死亡。
自此，曲帶著華胥轉移到九龍城地下守護著那座千萬人意識生活的城市—聯合共同體九龍。而維裡耶則帶著華胥的備份，統治著另一大演算係統九龍夜航船。
麗芙應召參軍，作為生命之星救援隊成員時執意救援被放棄區域，保存了大量有生戰力，但她自己卻瀕死接受改造成為構造體，後來她獲得一級榮譽勳章，升中尉。
同年，莫裡安為了救患有心臟病的弟弟莫瑞接受黑野改造，莫瑞和莫裡安（後稱裡）由此獲得空中花園的生活資格，裡加入黑野編外部隊。
萬事登上空花後因為重病一直不醒，萬緒利用遠程鏈接艙將萬事的意識投入擬意識海卻險些使萬事脆弱的意識被吞噬，隨後她在自己與萬事的腦中同時植入芯片，一同進入擬意識海，卻依舊沒有成效。在反複考慮後，為了治愈萬事，萬緒前往地表某研究機構，參與利用十歲以下的構造體孩子做實驗體的構造體意識海研究項目。
在項目中，萬緒在接入構造體意識海時發現萬事的意識同樣可以存在於此，於是利用構造體孩子的意識海維護萬事的意識，教導其與地球等相關的知識，並將自己關於該研究機構的記憶封存在萬事的意識中。最終在不斷的刺激下，遠在空中花園的萬事帶著萬緒與眾實驗體的記憶醒來，隻記得自己與母親在意識海中的相處，能夢到實驗體的恐怖經曆。
蘇醒後的萬事由萬緒托付的同事梅爾薇照顧，在生命之星兒科做康複訓練。一次偶然的機會中，萬事見到了構造體維護科在大型作戰後搶救構造體傷員的場麵，並戳破了實習醫生對失去母親的佩洛的謊言。在這次經曆後一周，萬事被送往青少年培育中心，與佩洛成為室友。
2163～2165年，常羽輾轉至奧賽蘭姆號；科亞犧牲，卡穆初現。
薇拉、庫洛姆、萬事…相繼成為構造體。
羅塞塔成為守林人，阿爾法出現。
2166年，露銘為了測試自己的能力，炸毀了18的空中花園，5月後開始組織修複。
2167年，賽琳娜出生。
2169年，艾拉出生。
2170年，諾安出生。
2171年，希卡出生。
2185年，空中花園修複完畢。
2186年，首席因為任務原因錯過了賽琳娜盛情邀請的阿卡狄亞大撤退話劇首演。
2187年，4月，101novel.com歲的賽琳娜在多年創作經曆的影響下，為了觸碰更真實的世界而選擇成為構造體，隸屬於空中花園藝術協會考古小隊，因為國際空間站搜尋作業之故。
她失約於與首席約定的舞會，她所在的藝術協會特彆小隊偶然發現隱藏在空間站內的帕彌什異聚核心，為了保護來之不易的異聚核心碎片樣本，小隊全體犧牲，賽琳娜與空中花園失聯，忍受著巨大痛苦的她獨自一人守護著核心碎片並不斷向外發送《暴風雨》特征訊息，以求有朝一日摯友艾拉能夠發現。
同年，艾拉也懷著同樣的目標接受改造成為構造體，加入空中花園藝術協會考古第3小隊，她從未放棄過尋找賽琳娜。
同年，灰鴉指揮官以法奧斯軍事指揮學校首席指揮官的身份畢業，加入執行部隊。
在進行小隊自由組建時於安排下選擇重啟後的露西亞作為隊長，後來在尼科拉和黑野的授意、以及露西亞的同意下，裡和麗芙加入灰鴉小隊，新灰鴉小隊由此成立。
同時間，提法所在的朱雀小隊成立。
同年冬天，17歲的諾安初次見到貝拉·貝特，進行工作交接。工作期間出現事故，一人死亡，諾安與工蜂部隊隊員交談。
之後，上層守衛發現“幸運盒子”有問題要檢查（其內是蕾切爾為下層反抗而準備的武器），事故死亡者的妻子操作機械砸死三名上層守衛，眾人決定上報其死因為事故，貝拉決定為此作證。最後諾安知道貝拉的名字，但貝拉不知諾安的名字。
2190年，乾預無儘輪回實驗，提法成為苦刑之女；…………
…………………
畫麵一轉。
時間2190年。
地點空中花園—司令部—尼科拉辦公室。
露銘一臉不可置信地看著尼科拉說道。
“合著我才上來幾天，你就得讓我下去執行任務了？這也太突然了吧！”
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尼科拉嚴肅地點點頭回答道“是的！而且這次任務非常特殊，難度極高，上頭指名道姓的需要你去參加。”
露銘皺起眉頭問道“方便透露一下具體的任務信息嗎？”
尼科拉猶豫了一下說“可以，但不多，剩下的信息需要你與你的指揮官核對，我所知道的有限。”說完，尼科拉將一個平板遞給了露銘。
露銘接過平板後迅速瀏覽起來，同時繼續追問道“那我什麼時候出發呢？”
尼科拉看了看手表回答道“具體時間等下會有人告訴你，剩下的事情就讓賽利卡跟你細說吧，我還有一個緊急會議要開，先失陪了。”話音未落，尼科拉便轉身離去，腳步匆匆，沒有絲毫留戀之意。
賽利卡“露銘，走吧這邊。”賽利卡從門外走了進來，她的身旁緊跟著一位年輕的男子。這位男子身材高挑，步伐穩健，透露出一股堅毅和果敢。他身著一身指揮官標準作戰服，腰間彆著一把專門配置的製式槍，整個人顯得格外乾練利落。
露銘“喲！賽利卡，你身後的這位是誰呀？”露銘好奇地打量著這位陌生的男子，眼中閃爍著疑惑的光芒。
賽利卡“哈哈！來，我給你們介紹一下，這位就是你的新指揮官，他可是擁有二級軍銜的哦！”賽利卡的語氣中帶著一絲自豪。
露銘“二級軍銜？那是什麼意思啊？”說實話，露銘對這個軍銜的概念並不太清楚，他不禁皺起眉頭，露出困惑的表情。
賽利卡“嗯，簡單來說，跟你的等級差不多啦。”賽利卡試圖用最簡單易懂的方式解釋給露銘聽。
露銘“哦哦，這樣啊。”雖然還是有點似懂非懂，但露銘也點了點頭，表示明白了。
賽利卡“好了，現在正式介紹一下。這位是你的指揮官，他叫冬澤月。冬澤月，這位就是你的構造體隊員，他叫露銘，是空花基地唯一的一位ss級構造體哦！”賽利卡將兩人相互介紹給對方。
冬澤月“啊，你好，露銘。很高興認識你。”冬澤月向露銘伸出手，微笑著說道。
露銘“你好，冬澤月指揮官。以後請多多關照！”露銘也禮貌地回應道，與冬澤月握了握手。
露銘和他的指揮官兩人寒暄過後，便在賽利卡的引領下朝著發射平台緩緩走去。沒過多久，他們就抵達了目的地。趁著尚未有飛船前來接應並將他們送往指定地點的這段時間裡，兩人尋得了一張長椅坐下稍作歇息。
冬澤月突然想起什麼似的，開口說道“哦，對了，有件事必須要先告訴你一下，我們這個小隊的名稱叫做‘白鴞’。”
露銘疑惑地回應道“可是我記得，一個精英小隊的標準配置應該是由三個構造體加上一名指揮官所組成吧？”
冬澤月點了點頭，解釋說“嗯，沒錯。不過上頭有特彆交代過，由於你的構造體具備特殊性，它的性能更適合去執行那些高強度的戰鬥型任務。因此，我們這支小隊主要負責的是前線作戰以及清剿大範圍的感染體等艱巨使命。可以說，我們白鴞小隊在眾多隊伍當中屬於比較特彆的存在。”
露銘“哦！那這次的具體任務，那指揮官，任務是不是可以告訴我了。”
冬澤月“那是當然，這次的任務也十分的簡單，就是去接應021城市被感染體包圍的精英小隊。”
露銘“021城市？就是那個前幾天過濾塔被毀了的城市。”
冬澤月“沒錯，就是那裡。這次我們要去接應的，可是大名鼎鼎的灰鴉小隊。”
露銘“灰鴉小隊！我聽說過他們，他們確實挺有名的。”
冬澤月“嘿，你可彆小看了灰鴉小隊。他們可是一支非常優秀的精英隊伍，曾經完成過許多艱巨的任務。而且，他們的隊長還是法奧斯學院的首席指揮官呢！”
冬澤月“可不是嘛！我跟你說啊，上次灰鴉小隊在執行任務的時候，遇到了一大群感染體的圍攻。但是，他們並沒有退縮，而是奮勇作戰。尤其是那位首席指揮官，他簡直就是一個戰神！他孤身一人衝進敵陣，手撕感染體，那種場麵，真是太震撼了！”
冬澤月“嘿嘿，這就是人家的實力啊！據說，他擁有著超強的戰鬥技巧和敏銳的反應能力，再加上他那無與倫比的勇氣和決心，才能在那樣危險的情況下化險為夷。”
露銘“啊…是嗎？”露銘略顯尷尬的複合著。
冬澤月“不過，現在我們還是先把眼前的任務完成吧。畢竟，灰鴉小隊還在等著我們去救援呢。”
露銘“嗬嗬，好的，我明白了。”
此時的露銘心想，劇情到這兒了啊，我記得這次是露西亞意識回傳後再次執行任務時與阿爾法的相見之後被釘在了牆上，嘶～看來得哪天有時間去看一看小露娜了。
正在此時，不遠處有一群小隊構造體慢慢地走了過來。當冬澤月和露銘注意到他們朝著這個方向走來時，便立刻站起來向前走去與他們進行交涉。經過一段時間的交流，才發現這一隊人是來協助他們完成此次任務的。由於灰鴉小隊的原因，尼科拉特彆安排了這支小隊來協助露銘。正當幾個人交談的時候，一輛運輸飛船也降落在了發射台上。看到飛船已經到達，大家也不再多說話，而是一同走向飛船的船艙內部。
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冬澤月看了看手中平板上顯示的位置信息，然後對著坐在船艙裡的眾人喊道“距離目的地還有2公裡，請大家做好準備。”
露銘輕聲回應道“明白，對了指揮官，等到達接應地點後，我可能需要出去一下。”他小心翼翼地對著身旁的指揮官低語。
其他人異口同聲地回答“是！”
冬澤月壓低聲音，對著露銘說道“咱們小隊剛剛成立，你可彆給我惹事啊。”他的眼神中透露著一絲無奈。
露銘“什麼話！我怎麼可能會去作妖呢？”露銘一臉的坦蕩，他的表情非常真誠，讓人不禁相信他所說的話。
此時，在012城市的一處空曠地內的上空，一輛龐大的運輸飛船緩緩降落在空地之上。飛船的降落引起了一陣灰塵飛揚，同時也吸引了一小群感染體的注意。這些感染體嗅到了獵物的氣息，它們張牙舞爪地向飛船撲來，似乎想要吞噬裡麵的生命。
然而，就在感染體即將靠近飛船的瞬間，一道冰藍色伴隨著閃電的刀光如同閃電般劃過空中。這道刀光異常淩厲，帶著無與倫比的威勢，將這群感染體全部一刀腰斬。刹那間，鮮血四濺，感染體的身體被切成兩段，倒在地上抽搐著死去。
露銘回頭看了一眼身後的飛船和人群，然後大聲喊道“指揮官！我去去就回，你先組織大家在這裡布置陣地。”話音未落，他便如同一顆子彈般迅速竄出，身形敏捷地衝向遠方。他的速度極快，眨眼間便消失在眾人的視線之中，隻留下一串塵土飛揚的痕跡。
此時，在一處莊嚴而寧靜的教堂內，灰鴉小隊的4人邁著緩慢而謹慎的步伐走入其中。就在他們接近教堂出口時，一道耀眼的陽光從門口射來，一個神秘的白發女性出現在他們眼前。
麗芙驚訝地看著這位不速之客，心中湧起一絲疑惑"對方是構造體——是友軍嗎?"然而，就在這時，白發女性的身體周圍突然閃爍起詭異的紅色電流。麗芙立刻察覺到不對勁，她緊張地喊道"不對這是極高濃度的帕彌什反應!對方是感染體!"
麵對這個突如其來的變化，露西亞感到一陣困惑和不安。她努力想要看清對方的容貌，但卻發現自己的視線變得模糊不清，仿佛視覺信號出現了錯誤。她的思維也開始變得混亂起來，難以集中精力。
露西亞喃喃自語道"指揮官我現在好像有點奇怪我無法辨識她的外貌像是視覺信號發生了錯誤思緒也有些混亂"一旁的麗芙趕緊安慰她說"我這邊看得很清楚啊"
裡冷靜地觀察著局勢，他分析道"看來這種情況隻發生在露西亞身上。"麗芙焦急地說"等等露西亞的意識海穩定程度在下降！但並不是受到帕彌什病毒的影響，這到底是怎麼回事？"
正當大家陷入困惑之際，那個不明構造體阿爾法開口了，她輕聲呼喚著露西亞的名字"露西亞"聲音中似乎透露出一種熟悉而又陌生的情感。露西亞聽到這聲呼喊，心中不禁一震，一種莫名的親切感湧上心頭。她試圖靠近對方，想要弄清楚這一切背後的真相。
不明構造體α“錯誤，必須在此終結……”隨著這句話說出口，不明構造體以驚人的速度從腰間抽出一柄鮮紅的長刀，動作一氣嗬成。它手持長刀，一步步向露西亞逼近，同時露西亞也默默地從腰間抽出一柄黑色的的長刀。
露西亞“指揮官！請允許我獨自麵對他。”
指揮官“好！”得到許可後，露西亞毫不猶豫地向前衝去。瞬間，雙方的刀刃頻繁碰撞，火花四濺。然而，正當激戰正酣之時，露西亞的攻擊節奏突然略微停頓了一下。而這一瞬間的破綻，卻被對麵的不明構造體敏銳地捕捉到了。隻見它迅速出手，露西亞手中的刀被猛地彈飛至半空之中……
麗芙“露西亞！”
對方輕鬆地抬手接住了半空中的刀，緊接著以雷霆之勢將露西亞死死地釘在了斷壁之上，徹底封鎖了她的行動。
露西亞“呃——”
露西亞，她用儘全力想要把手臂掙脫下來，但每次嘗試都會讓破損的手臂流出更多的構造體循環液。儘管如此，露西亞仍未放棄，繼續努力掙紮著。