埃爾帕索軍團隻打了四天就投降，這完全出乎了休斯頓的意料。
按照休斯頓的估計，哪怕安東尼將軍再不濟，也能撐上幾個月。
之前在阿拉莫一百多人都能堅持十六天，可見墨西哥人根本不會攻城。
埃爾帕索軍團有超過兩千人，還有不斷從美國各地趕來的誌願兵的支持，自己還留下了一個團兵力在奧斯丁幫忙策應
但埃爾帕索軍團支堅持了四天，還損失了整個德克薩斯一半的火炮。奧斯丁也岌岌可危，休斯頓的主力部隊，加上波士頓來的誌願兵，也隻有1500人。
現在休斯頓有兩個選擇
一個是繼續前往美國，寄希望於美國能及時出兵救援奧斯丁。
當然這幾乎是不可能的，即使美國出兵也不可能在幾天之內到達奧斯丁，如果奧斯丁的守軍真要等待美國人的支援，恐怕在支援趕到之前整座城市早已化為一片焦土了。
二是立刻回奧斯丁，沿途收集一切能收集到的物資和兵馬，死守奧斯丁，等待美國發兵救援。
當然，他極有可能像之前的阿拉莫軍團和埃爾帕索軍團一樣，被戰火所吞噬。
但奧斯丁是一座堅城，城高池沉，糧草充足，同時又是德克薩斯北部平原的最後屏障。
德克薩斯一旦陷落，北部平原將無險可守，墨西哥人一旦在奧斯丁紮穩腳跟，再想將墨西哥人趕出去就要付出巨大的代價。
休斯頓經過了激烈的思想鬥爭，他決定回去，和自己的士兵在一起。
最後休斯頓，成功在墨西哥人完全封鎖奧斯丁的道路之前，回到了奧斯丁。
1836年5月25日，奧斯丁圍城戰正式開始。
5月28日，奧斯丁南部城牆坍塌。
5月30日，奧斯丁南部城牆陷落。
6月1日，德克薩斯軍奪回了南部城牆。
6月2日，南部城牆再次陷落。
6月3日，德克薩斯軍再次奪回南部城牆。
6月4日，墨西哥軍用挖掘地道的方式，在北城門下埋設炸藥，炸開了北城門。
6月5日，奧斯丁城牆全部陷落。
6月6日，墨西哥軍要求奧斯丁守軍投降，但遭到奧斯丁守軍拒絕。當日墨西哥軍對城區的街壘進行了炮擊。
6月9日，墨西哥軍要求奧斯丁市民離開城區，德克薩斯軍要求奧斯丁市民不要離開自己的家。
6月10日，巷戰開始。
由於奧斯丁的守軍抵抗頑強，墨西哥軍不得不一間房一間房的搜索，一條街一條街的占領，雙方都付出了巨大代價。
同時，這種戰鬥對於奧斯丁的居民來說也是一種煎熬。
他們不知道什麼時候，就會有人衝進他們的家裡，搶走他們的食物，奪走他們的性命。
他們不反抗是死，他們拿起槍反抗，就會被雙方認為是敵對方的士兵，然後開槍打死。
6月15日，墨西哥軍在攻城戰中傷亡，已經超過3000人。塔桑·安納要求停止進攻，並且下令放火燒城。
6月18日，大火燒了三天三夜，可能是老天看不下去，天下起了雨。
休斯頓看著天上淅淅瀝瀝地小雨，和逐漸熄滅的火勢，他知道當雨停的時候，就是墨西哥人發動最後進攻的時刻。
休斯頓望著自己的手下們，這些人已經連續戰鬥快一個月了，幾乎人人帶傷，但卻沒有人想要投降，這讓他十分欣慰。