不知不覺時間已經來到的99年，這一屆的拳皇格鬥大賽是這由nests公司舉辦的。
nests全稱是nest·und（音巢）。nests組織最初是個從事和平事業的貿易組織，是以nests本人的名字命名的。他本人是個和平主義者。但他後來被自己的獨生兒子伊格尼斯所殺，伊格尼斯把nests徹底變成了一個龐大的軍事組織，將nests徹底變成一個實現自己野心的工具。
nests擁有世界一流的科學技術，特彆是在“生命體實驗”上有著非常高的造詣，各種克隆草薙京的出現就是最好的證明。在nests禁斷的克隆技術下，製造出很多的人倫慘劇。
伊格尼斯為了為了實現自己成為‘神’的夢想，製定了“蔚藍之神計劃”——殺掉kof冠軍，然後君臨天下。並且策劃了一連串的恐怖襲擊事件，不過都以失敗而告終。最後他本人也在與k對決中隕落。
nests組織相比大蛇一族和遙彼一族最大的不同是，它有著龐大的體係和鮮明的階級，成員數量也是三個組織最多的。
而nests組織以草薙京的血所克隆的第一個實驗體就是有著一頭白發的k。
k初登場的時候和草薙京一樣，隻有16、7歲，但k的傲慢和叛逆，則更勝一籌。如果說草薙京隻是懶散和沒有鬥誌的話，k就是一個十足的問題少年。
而這樣一個問題少年，作為拳皇nests篇的男主角，步入了我們的視線。
nests組織劇情發生在kof97最終之戰的兩年後，當年拯救世界的英雄草薙京也整整失蹤了兩年了。而這個時候，各大格鬥家又收到了一封神秘的邀請函，參加kof99格鬥大會。為了尋找草薙京的下落，紅丸與矢吹真吾也允諾參加大會，並合k"以及馬克西姆一隊。
k和馬克西姆對紅丸二人隱藏了自己的身份，其實兩人是世界最大的組織nests的手下，擁有火焰力量的k更是nests殺手中的佼佼者。
在格鬥大會的過程中，很多疑點也開始暴露出來。以海頓將軍為首的國際傭兵組織發現了大量私人部隊在全世界範圍集結。
而令人無比驚訝的是，這些私人部隊竟然全都是草薙京!
最終，k一行人來到了決賽的地下比武場，見到了這一次拳皇大賽的主辦人古力查裡度。
他話不多說就和冠軍隊也就是主角隊開始了戰鬥，而被擊敗後，他嘲笑了紅丸等人的愚蠢，原來他穿的戰鬥服是用來收集最強的kof獲勝隊的數據的,這些數據將被傳送到全世界的克隆人草薙京身上，已完成對他們強化的最後一環。而這些nests的克隆人部隊將進攻世界各大要點並讓整個世界陷入混亂，達到nests統治世界的目的。在自認為萬無一失之後，他燒掉了戰鬥服，告訴k，自己是組織nests的乾部，k不過是自己的克隆人罷了，而他現在要來除掉這個礙眼的克隆人了，然而諷刺的是古利查力度才是k的克隆人。
一番激戰，k還是打敗了古力查裡度。無法接受自己敗給自己克隆人事實的古力查裡度，卻忽然接到了上司的指令，原來在海頓將軍為首的國際傭兵部隊的圍攻下，克隆人草薙京已經被全部擊敗，計劃失敗了。而作為失敗者和棄子，古力查裡度已經沒有利用價值了。
而在這一場戰鬥後，k卻察覺到了一個熟悉的感覺在靠近自己。
來人便是草薙京，原來nests在大蛇與三神器的戰鬥過程中一直從旁窺測，直到最後分出勝負，本想等三神器負傷的時候坐收漁翁之利nests卻沒料到強悍的大蛇居然如此廢材，隻得暫且退避，待草薙京放鬆警惕的時候偷襲了草薙京帶回了研究基地。
在這兩年裡，nests推行了兩種研究，一種是實驗如何讓正常人駕馭草薙一族的火焰以提高戰鬥力，另一種就是克隆草薙京。k作為nests第一種實驗的一個試驗品，在無數次的試驗過程中，被清洗了過去的記憶。唯一熟悉的感覺就是草薙京。因此他覺得草薙京多多少少知道一點關於自己過去的信息，所以一直想找到草薙京。
其實草薙京對他的過去一無所知，他這種熟悉的感覺隻是因為草薙之血的火焰之力在他體內植根而產生的親切感罷了。
於是k和京進行了一場短暫的交鋒，但是很快這一場戰鬥就被nests打斷了。古力查裡度的上司毫不諱言的告訴k，他的力量就是來自於草薙京。這兩年來為了研究，nests從草薙京的體內抽走了大量的血液，導致了草薙京力量大幅弱化，本來可以被使用自如的無式也再也無法使用了。這讓草薙京對nests產生了無比的恨意，發誓一定要鏟除nests。
而nests事後進行了仔細的調查，發現原來是八神一路尋找草薙京的蹤跡，一直尋找到了nests的秘密基地，並毀掉了整座基地，這才導致了京的逃脫。
而這一屆的拳皇格鬥大賽除了以往的老麵孔外新加入了不少格鬥家。
分彆是k，馬克西姆，薇普，包，藤堂香澄，李香緋，四條雛子以及金甲喚的師兄元劭。
由於這次大賽規則改變，分成了四人一組，所以參賽隊伍隻有七組。
選手休息處，“呐，師傅，這是這次大賽的選手名單，我們第一場的對手是特瑞他們的餓狼隊！”雅典娜將名單遞給鎮元齋，現在的雅典娜上身穿的是露臍短衫，下身是火辣的超短褲，露出了性感的腰腹和大腿，那瀑布般的長發被她剪成了齊耳短發，少了一些青春，多了一些知性，鎮元齋曾經問過雅典娜為什麼剪短，她表示要跟過去跟任忠龍劃清界限，迎接嶄新的自己。
ps:
音巢篇都想看的話那我就寫長一點羅
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