某天雨夜，蒼天藍羽拿著他買的安眠藥從藥店裡出來，廣田雅美死後蒼天藍羽陷入了深深的自責，自責他為什麼沒趕到現場，自責他為什麼沒能殺掉琴酒和伏特加，自責他為什麼沒能救下廣田雅美……
深深的自責害得他精神出了大問題，特彆是廣田雅美被冤枉是運鈔車劫案主要負責人，蒼天藍羽已經記不清楚他有多長時間沒說過好覺了，可能一天，或者幾天，每當他睡著都能看見廣田雅美和他妹妹慘死在他麵前。
目幕警官從柯南那裡得知了蒼天藍羽消沉的原因後拍著胸脯保證他一定會洗清廣田雅美的冤情，他希望自己的幫助能讓蒼天藍羽振作起來，或者讓他心情好受一點。
毛利蘭替他給學校請了病假讓他在家裡休息，同時也時不時來到工藤宅安慰和照顧蒼天藍羽。
毛利小五郎改掉了平常的懶散，全力以赴的跟目幕警官調查案子，他希望自己的幫助能讓蒼天藍羽的心情好受點。
柯南試著從蒼天藍羽套話，試著套出他把廣田雅美埋在哪裡了，但是他當提到廣田雅美這個名字蒼天藍羽就會精神崩潰跪在地上嚎嚎大哭，嘴裡一直在念對不起一類的詞。
那之後認識蒼天藍羽的人都達成了一個共識永遠都不要當著蒼天藍羽的麵提起廣田雅美。
在藥店裡買好安眠藥後蒼天藍羽來到停車場騎摩托車回家，在回家的途中，他看見一個讓他感到很熟悉的小身影走在街道上……
幾天後，帝丹小學
柯南一如既然來到學校，步美看見他來了後詢問蒼天藍羽的情況“柯南，阿羽哥的情況怎麼樣了？”
“小蘭姐姐告訴我阿羽哥的精神狀況要比以前好很多了，至少沒那麼消沉了。”
光彥“阿羽哥能走出來就好。”
元太“畢竟雅美阿姨的死對他的打擊實在是太大了。”
步美“好了，咱們就不提這些了吧，對了，你們聽說了沒有？聽說從今天開始我們班又有一個轉學生了。”
元太“是真的嗎？”
光彥“自柯南之後就都沒有轉學生了，不知道他是怎麼樣的人呢？”
元太“是可愛的女孩就好了。”
光彥“不對不對，不管是男生還是女生，個性好不好這點最重要了。”
步美看向柯南“柯南。”
“嗯？”
“你覺得他會是個怎麼樣的人呢？”
“我看啊，搞不好又是一個死讀書的書呆子哦。”
“這麼說來你認為是男生了？”
元太看向步美“步美啊。”
“嗯？”
“你在老師辦公室沒看見這個人嗎？”
“我隻聽到他的名字，他姓灰原哦。”
元太“灰原哦。”
步美“對啊，就是灰色的灰，草原的原。”
光彥“這個姓還真奇怪。”
很快老師帶著轉學生來到柯南所在的教室“是個女生耶。”
“好棒哦。”
“好可愛哦。”
“同學們快回到位置上。”
“好。”
柯南看著新來的轉學生隻不過是個女孩子嘛，不過她為什麼很像羽毛小時候的情書裡麵所描寫的那個女孩呢？
老師在黑板上寫下名字“好，這位就是從今天起要跟大家一起念書的灰原哀同學，希望大家要好好跟她相處哦。”
“好。”
“很好，大家回答得很有精神，灰原同學要坐在哪裡呢？”
元太揮了揮手“老師，這裡，我的旁邊沒有人坐。”
灰原哀穿過了元太，直接坐在柯南旁邊的空位上“請多指教。”
“哦。”
元太回到座位上“什麼嘛，擺著一張臭臉。”
光彥“她好冷淡哦”
步美“我想她一定是緊張了。”
老師拍了拍手“好了各位同學，我們要開始上課了。
下午放學時間，灰原哀一個人走在走廊上，步美和柯南四人出現在她身後“灰原同學，我們一起回去吧。”
灰原哀看了看步美後自顧自的往前走，元太走了過來“不要理她了，真是的，擺什麼架子。”
“可是……”
光彥跑上前詢問灰原哀“請問，你家在什麼地方？你剛搬來對不對？”
步美跟著灰原哀“你不用客氣，我們幾個可以送你回家哦。”
“不用了，等段時間會有人來接我的。”灰原哀停下內心不知道他起床沒。
“那你家在哪裡呢？”
“米花區二號街21號，那裡就是我現在住的地方。”
“哦？”
元太看著柯南“怎麼啦？”
“沒什麼。”柯南奇怪了，她住在我家乾嘛？難不成是老爸老媽身邊的一個姓灰原的朋友把她寄放給小羽毛照顧？
灰原哀看了柯南一眼後走在前麵。
在一樓換鞋子的時候柯南四人把少年偵探團的事告訴了灰原哀“少年偵探團？你說說你們嗎？”
光彥點點頭“對，我們為了解決大家請我們偵探辦的各種案子，可是日夜都必須活動的哦。”
步美“灰原同學你也加入我們嘛。”
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“江戶川同學也加入了嗎？”
“對啊。”元太摸了摸柯南的頭“不過這個家夥應該可以說是我的手下啦。”
“蒼天藍羽呢？”
光彥說道“阿羽哥啊，阿羽哥沒加入我們，不過他是我們的支援，隻要我們需要幫助就能把他給叫過來。”
步美指向鞋櫃“元太的鞋櫃就是我們收信的地方。”
光彥“也就是說，大家都委托書都會丟到這個鞋櫃裡。”
元太“不過我們沒有告訴老師哦。”
柯南他早就知道了。
“每天都會有好多來信，都是要求我們幫忙解決謎題的。”
元太看了看鞋櫃“奇怪，一封信也沒有，平常都是滿滿的，今天大概是例外了。”
柯南平常也都沒有什麼信啊。
“我們快點到公園裡去踢足球吧。”
步美“好啊哈。”
光彥“這也不錯。”
“等等我。”元太穿上鞋子後發現裡麵有東西。
“有了，是委托書耶。”
“好耶。”
光彥說道“要不要給阿羽哥打電話……”
柯南說道“算了吧，阿羽哥現在隻是好轉了，並沒有完全恢複過來，就不叫他了，我估計又是什麼找人找貓的委托吧。”
柯南想的沒錯，的確是幫委托人找他突然消失不見的哥哥，他天真的以為人很快就能找到了，結果沒想到卷入一個印製和販賣假鈔的犯罪團夥，而且這個窩點就在警察局旁邊，他還差點以為這個假鈔團夥跟黑衣組織有關係。
同時在調查的時候柯南對灰原哀起了疑心，因為他發現灰原哀太反常了，根本就不像一個普通的小女孩，甚至目睹到了灰原哀拿著槍朝罪犯射擊，心想她是不是來自於那個黑衣組織。
直到他看見目幕警官把灰原哀嚇哭後柯南才明白他想多了女孩子果然還是女孩子，趕緊把她送到小羽毛那裡讓他去頭疼吧。
夜晚，柯南帶著哭泣的灰原哀走在路上“不要再哭了，你家就在這附近吧？”
柯南看著哭泣的灰原哀拜托，真的受不了啊，要是讓小羽毛知道她被弄哭了的話一定會算在我的頭上的。
柯南停下看著灰原哀“現在你可以自己回去了吧？”
“那我們明天見了？”
“明天學校見。”
灰原哀看著柯南“atpx4869和殘暴天使計劃。”
“什麼？”
“這兩樣你知道是什麼嗎？”
“一個是你吃的那種藥的名字，另一個是你弟弟經曆過的人體實驗。”
“你在說什麼啊？我才沒有吃過那種藥呢，而且我也沒有弟弟啊。”
“是嗎？這個藥名和這個計劃名字我是絕對不會弄錯的，因為那是組織命令我……”
“由我親自調製的藥，以及見證殘暴天使計劃的實行。”
“組織？做藥？人體實驗？不會吧，你這個小孩呢做什麼？”
“我跟你一樣，我也吃了那種藥，在細胞的自我破壞程式的偶發性作用之下使得神經組織之外的骨骼，肌肉，內臟，以至於毛發，所有的細胞都退化到成長過程的幼兒時期，這可是種神秘的毒藥哦。”
“至於殘暴天使計劃，那是組織為了創造出聽從他們指令的生物兵器而製定的計劃，創造出與正常人無異的人形怪物。”
“他們刻在dna裡的生物程序一旦被啟動，那就會變成一個誰都殺不死的人形兵器，最完美的實驗體當然是零號病人，也就是你的弟弟蒼天藍羽。”
“因為組織發現了他在被啟動後出現了自我進化，也就是說，在時間的推移下他會越來越強，變得更加嗜血。”
“灰原，難道說你是……”
“我不叫灰原。”
灰原哀看著柯南“雪莉，這才是我的密碼名稱，怎麼樣，沒有想到吧？”
“工藤新一，就算零號病人把你藏得再深，你還是被我們給找到了。”
“那，這麼說的話，你是那些黑衣人的同夥了？”
“現在沒時間讓你驚訝了糊塗大偵探。”
“什麼？”
“我說過了，我現在住的地方就在米花區二號街二十一號。”
“對，我就住在你的老家裡，跟你的弟弟零號病人住在一起，同時我也把你鄰居的事也給上報了。”
柯南難道說……小羽毛……還有博士。
柯南試著給蒼天藍羽和阿笠博士打電話後發現都沒人來接電話。
灰原哀看著驚慌失措的柯南“沒有用的，不管你怎麼打都是沒人接聽的。”