而廷尉李斯則力排眾議，主張廢除分封諸侯製度，全麵推行郡縣製度。
在秦始皇統一天下之前，縣大於郡，千裡百縣，縣有四郡。
秦始皇統一天下後，曾出現過應否置郡的爭論。當時不少大臣，特彆是李斯的上司王綰，認為原楚國、燕國、齊國等地的領土都遠離秦國，主張實行分封，授各地貴族予世襲的諸侯名份，惟身為廷尉的李斯認為分封製是周朝諸侯混戰的根源，他大膽地反駁道，周製訂的這個政策已經證明是一個政治災難。
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周王室的親戚一旦取得了他們的土地，立刻互相疏遠和進行戰爭，而天子則無力阻止他們，所以結論是“置諸侯不便”。他力排眾議建議實行郡縣製，並得到秦始皇的采納。
很顯然，李斯的主張符合專製皇權和統一的要求。因而得到了秦始皇的采納，將全國分為三十六郡。
在郡縣製下，共設三十六郡，每郡有守（相當於省長）、尉（相當於防區司令）和監（相當於監察專員）各一。
郡下轄縣；郡（守）與縣（令），由皇帝直接任命。秦代至此成為為中國曆史上最早在全境推行“郡縣製”的朝代。
至漢代仍承襲這個製度，形成州郡縣三級行政管理，自此成為日後各朝地方政製的基礎，直到唐朝，才被道路製所取代。
秦製滿萬戶以上的縣設縣令，不滿萬戶的縣設縣長，是為一縣之首。
縣令下設丞、尉。縣尉負責一縣的軍事和治安。由於秦王朝政權具有軍事專製的特點，所以縣尉的任務特彆繁重，舉凡一切軍事、治安、征發徭役、管理士卒等事，均要由縣尉主持完成，稍有差錯就要受到嚴厲製裁。
由於縣尉任務繁重，所以每一個縣的縣尉不止一人，可能有二至四個縣尉。
商鞅變法時，廢分封，行縣製。秦統一後，秦始皇采納李斯的建議，決定在全國範圍廢除分封製，以郡縣製作為中央控製地方的製度。
因而，郡，是中央政府轄下的地方行政單位，其組織機構與中央政府略同，設郡守、郡尉、郡監（監禦史）。郡守，為一郡最高行政長官，掌全郡政務，直接受中央政府節製；郡尉，輔佐郡守，掌管全郡軍事；郡監，掌監察工作。
郡守是郡的最高行政長官，對上承受中央命令，對下督責所屬各縣。
設置於少數民族聚居地的同級地方行政機構稱為“道”。
縣級以下有“鄉”、“裡”兩級地方基層行政機構。
此外，還有負責地方治安並兼管公文傳遞的“亭”。
就此看來，郡以下的縣，是秦朝統治機構中關鍵的一級組織，是從中央到地方政府機構中具有相對獨立性的一個單位。
滿萬戶以上的縣設縣令，不滿萬戶的設縣長。令、長為一縣之首，掌全縣政務，受郡守節製。
縣令下設尉、丞。尉，掌全縣軍事和治安；丞，為縣令或縣長的助手，掌全縣司法。
縣以下設鄉、裡和亭。鄉和裡是行政機構，亭為治安組織。
鄉設三老、嗇夫和遊徼。三老掌教化，嗇夫掌訴訟和稅收，遊徼掌治安。
鄉以下為裡，是秦國最基層的行政單位。裡設裡正或裡典，其職能除與鄉政權職能大體相同外，還有組織生產的任務。
此外，還有司治安、禁盜賊的專門機構亭。秦規定，兩亭之間相隔十裡，設亭長。亭遍布於城鄉各要地。
鄉裡的作用逐漸強化，並超過郡縣，民間有知鄉裡不知郡縣的說法。
春秋時期已有縣、郡的設置。春秋的縣可分為兩種類型楚和秦的縣都直屬於君主；晉、吳的縣多是卿大夫的封邑。
兩者都是直屬於國君的彆都，具有邊防重鎮的作用。
楚武王滅掉權國，將其改建為縣，是為設縣之始。春秋後期，縣製開始逐漸推行於內地。
戰國時期，縣的設置已較廣泛，並轉變為作為地方政權而實行官僚製度的縣製。縣令為一縣之長，由國君任免。縣之下有鄉、裡等作為國家對居民進行控製的基層組織單位。
郡的設置要較縣為晚。秦穆公九年（前651），晉公子夷吾（即晉惠公）對秦國使者談到“君實有郡縣”，為秦國設郡的最早記載。而後，晉、趙、吳相繼設置了郡。
這一時期的郡地位比縣為低，但縣與郡之間並無相統屬的關係。到了戰國時期，有名可考的最早設置的郡當為魏文侯時的西河郡（吳起曾為西河守）、上郡和楚悼王時的宛郡。
隨著邊防設郡之地逐漸繁盛，內地的縣逐漸增多，需要建立起更高一級的管理機構，於是就形成了郡、縣兩級製的地方管理體係。郡守為郡之長，多由武官充任，有征兵領軍之權。
至戰國末年，各國郡縣的設立已經很是普遍了。
郡縣製，是中國古代實行的中央集權體製下，郡、縣二級政權的地方行政製度的總稱。是分封製之後出現的地方管理行政製度。
相較於分封製，為什麼郡縣製更能維護一個國家的高度統一呢。
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