祖孝孫，字德懋，範陽郡遒縣人，隋唐時期樂律學家，民部侍郎祖崇儒的兒子。隋朝時期，憑借門蔭入仕，起家協律郎、益州司法參軍，遷北絳縣令，授侍禦史。唐朝建立後，擔任著作郎、上騎都尉，曆任選部郎中、天策府從事中郎、登州彆駕、太常寺丞、吏部侍郎，冊封範陽縣男。貞觀年間，累遷太常少卿。
祖孝孫，受詔與協律郎竇進等定樂，其律學著述多亡佚，部分篇章收在《音樂誌》、《禮樂誌》中。樂成，按隋代宮廷中鐘樂的十二律，“其五鐘設而不擊，謂之啞鐘”，經祖氏家學的律學理論與張文收的“耳決之明”相結合，才在實踐中真正解決了調律和十二律旋宮的問題，自此成為唐以後曆代樂律誌中的千古美談。
太常少卿祖孝孫奉命教授宮人音樂，不稱太宗心意，受到責怪，侍中王珪與中書令溫彥博諫道“祖孝孫乃是高雅之士，您讓他去教宮女，進而又責怪於他，臣認為與禮不和。”唐太宗大怒“朕將你們視為心腹，你們就應竭忠對我，如今卻附順臣下欺罔君上，難道是為祖孝孫說情嗎。”溫彥博急忙謝罪。王珪仍道“陛下以忠直責怪我，難道我說的話含有私心嗎。這是陛下有負於我，並不是我有負於陛下。”唐太宗默然。
張文收繼祖孝孫業績，再次定樂而受頒賜之時，祖孝孫已故，除有關《音樂誌》、《禮樂誌》載有他的學說之大要外，所有律學著述都沒能傳下來。
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