排除了三楊這一批成宣時期的臣子後，以哪個臣子作為紫閣功臣之首，那就很好選了。
很多人都想到了一個名字：於謙。
這個人的功績，可以說是怎麼誇讚都不為過。土木堡之變後，正是在於謙主持下，大明取得了北京保衛戰的勝利，免去了一次可能堪比靖康之恥的大禍，沒有讓那時的大明，像宋朝成為南明。
可以說，於謙在很多人心目中，都是功勳卓著的名臣。再加上他含冤而死，被很多人同情。紫閣中的臣子，都想到了皇帝想把於謙，列在功臣首位。
和於謙一樣擔任兵部尚書、而且和當年的於謙一樣作為九卿之首，袁可立率先說道：
“於忠肅公有功於國，當為紫閣功臣！”
群臣紛紛附和，認為於謙應該是紫閣功臣。
朱由檢對此表示讚同，當即向群臣道：
“於少保有功於國，確實應該是紫閣功臣。”
又口占一詩，向群臣道：
“江山也要偉人扶，神化丹青即畫圖。”
“賴有嶽於雙少保，人間始覺重西湖。”
“於忠肅公，就是大明的嶽武穆。”
“董侍郎，由你為於忠肅公畫像，懸掛紫閣之中。”
“朕要讓後人記住，於謙是社稷功臣！”
對於於謙這個人，不是沒有爭議。主要的爭議點，就是於謙是否是忠臣。
畢竟在英宗皇帝被俘後，於謙不顧瓦剌的要挾，請皇太後立郕王為皇帝。所以一些人認為，於謙對英宗皇帝不忠。
然後在景泰皇帝病重時，於謙手握兵權，卻又在奪門之變時毫無作為，坐視景泰皇帝被廢。被一些人認為，於謙對景泰皇帝不忠。
這兩件事，讓於謙受到一些非議，認為他不是一個忠臣。
但是從於謙束手就縛、含冤而死來看，朱由檢認為他是忠臣。隻不過他忠於不是某位皇帝，而是大明社稷。
所以朱由檢稱於謙社稷功臣，列在紫閣首位。他要用這個做法，表明自己的態度。
對於謙排在這個位置，群臣大多是服氣的。就連之前把三楊列在首位的內閣大學士，也提不出異議。
畢竟於謙的功勞實在太大了，皇帝說他是扶保江山的偉人，那是毫不為過。
而且因為於謙含冤而死，和嶽飛的結局相似，深受人們同情。
以於謙作為功臣首位，能把紫閣功臣的名聲，在天下間很快確立。如果有哪個紫閣功臣的名字不太知名，隻需要說一句“他和於謙一樣都是紫閣功臣”，就能讓人知道，這個人有多大功績。
朱由檢也是因此，把於謙放在首位。總不能像宋朝的昭勳閣那樣，列了一堆不怎麼知名的人，卻把寇準、範仲淹、狄青、嶽飛等人，儘皆排除在外——
事實證明，嶽飛英名不朽，宋理宗設立的昭勳閣，則是少有人知。
朱由檢設立紫閣，當然不能犯這樣的錯誤。所以他堅決否定了三楊，把於謙列在首位。
而且為了鼓勵群臣立功，朱由檢還要對於謙大力褒揚，要讓人們知道，自己對功臣的態度：
“國初之時，多有功臣被追贈國公、郡公者。”
“朕以為憑於謙的功績，也應追贈國公。”