秦始皇巡遊、秦始皇東巡、徐福東渡從齊燕來的儒生方士們把儒家的“封禪”也作了改頭換麵的修改了一遍，盛傳自古帝王莫不舉行封禪典禮。
始皇帝二十七年（公元前219年）至始皇帝三十二年（公元前215年），秦始皇連續到東方沿海，江淮流域以及北邊等地巡遊，所到之處，無不刻石頌其功德。
到了統治後期，秦始皇迷戀長生不死之術，篤信命數。又說海上有蓬萊、方丈、瀛洲三島，是神仙居住的地方，有“不死之藥”，服後便可“長生不老”。
秦始皇想成為“長生不老”的神仙。有些怪迂苟合之徒，如盧生、韓終、徐福、侯生，都投奔秦朝。
盧生勸說秦始皇道“我們尋找靈芝、奇藥和仙人一直找不到，一定是有什麼東西與它們相克。我們建議您要不時秘密出行，來驅逐惡鬼。惡鬼避開了，神仙真人才會來到。您居住的地方如果讓臣子們知道，就會妨害與神仙交往，希望您所住的宮室不要讓彆人知道。這樣，不死之藥或許能夠得到。”
秦始皇就對外宣稱說“我慕神仙真人，我自己就叫‘真人’，不再稱‘朕’了。”
他還下令鹹陽附近二百裡內的二百七十座宮觀都用天橋、甬道相互連接起來，把帷帳、鐘鼓和美人都安置在裡邊，全部按照所登記的位置不得移動。
皇帝所到的地方，如果有人說出去，就判死罪。徐福等人入海尋找仙藥，花費了很多時間和錢財也沒找到。他害怕遭受責罰，就欺騙秦始皇說稱海中有三神山。但我們時常被大鯊魚困擾，所以無法到達。希望皇上派善射之人一起前往，遇到大鯊魚就用連發的弓弩射它。”
恰巧秦始皇做夢與海神交戰，海神的形狀與人形相似。占夢的博士說“水神本來是看不到的，他用大魚蛟龍做偵探。現在皇上的祭祀周到而恭敬，卻出現這種惡神，隻有把它除掉才能找到真正的善神。”
於是秦始皇命令入海的人攜帶捕大魚的工具，親自帶著弓弩去射殺了一條大魚。秦始皇派他帶領三千童男童女，乘樓船入海求仙山，後不知所終，或許是遇海難，或許是漂到某海島定居，後者可能性更大，民間傳說是到日本去了。]
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焚書坑儒
始皇帝三十二年（公元前215年），秦始皇又使燕人盧生求羨門、高誓等仙人蹤跡，後來又使韓佟、侯公、石生求仙人不死之藥。
對於秦始皇這種行為，也有儒生表示勸諫的，博士齊人淳於越建議始皇仍實行分封宗室子弟為諸侯的政策，始皇交給臣下討論。丞相李斯反對。
李斯的奏議促成了秦始皇帝下令焚書禁書，規定史書非秦紀皆燒之；非博士官所職，天下敢有藏《詩》、《書》、百家《論》者，悉詣守、尉雜燒之；有敢偶語《詩》、《書》者，棄市；以古非今者，族。吏見知不舉者與同罪。令下三十日不燒，黥為城旦。準保存者，醫藥卜筮種樹之書。若願學法令，則以吏為師。始皇心裡已感到受騙，於是命令禦史案問諸生，互相揭發牽連四百六十餘人，始皇下令把他們都在鹹陽活埋。有人認為《史記》記載秦始皇坑殺的乃是術士，]並不是儒生，但根據《史記·秦始皇本紀》記載秦始皇坑殺的人“皆誦法孔子”。
沙丘之變
秦王政三十七年（公元前210年），秦始皇死於他第五次東巡途中的沙丘宮（今河北省邢台市廣宗縣）。
秦始皇死後，趙高采取了說服胡亥威脅李斯的手段，二人在沙丘宮經過一番密謀，假造秦始皇發布詔書，由胡亥繼承皇位，還以秦始皇的名義指責扶蘇為子不孝、蒙恬為臣不忠，逼迫他們自殺，不得違抗。
在得到扶蘇自殺的確切消息後，胡亥、趙高、李斯這才命令車隊日夜兼程，迅速返回鹹陽。為了繼續欺騙臣民，車隊不敢捷徑回鹹陽，而是擺出繼續出巡的架勢，繞道回鹹陽。由於暑天高溫，秦始皇的屍體已經腐爛發臭。為遮人耳目，胡亥一行命人買了許多“鮑魚”裝在車上，“鮑魚”的味道掩蓋了屍體的腐臭味，迷惑了大家。
回到鹹陽後，胡亥繼位，是為秦二世，趙高任郎中令，李斯依舊做丞相，但是朝廷的大權實際上落到了趙高手中。趙高陰謀得逞以後，開始對身邊的人下毒手。他布下陷阱，把李斯逐步逼上死路，李斯發覺趙高陰謀後，就上書告發趙高。
秦二世胡亥不僅偏袒趙高，並且將李斯治罪，最後將李斯腰斬於鹹陽。趙高升任丞相，由於他可以出入宮禁，特稱“中丞相”。
首稱皇帝
秦始皇之前的各國諸侯都被稱為“君”或“王”。戰國後期，秦國與齊國曾一度稱“帝”，不過這一稱號在當時並不同行。
一統天下的秦始皇，以為這些稱號都不足顯示自己的尊崇，於是下令大臣議稱號。經過一番議論，丞相王綰、禦史大夫馮劫、廷尉李斯等人認為，秦王政“興義兵，誅殘賊，平定天下”，功績“自上古以來未嘗有，五帝所不及”。他們援引傳統的尊稱，說“古有天皇，有地皇，有泰皇，泰皇最貴”，建議秦王政采用“泰皇”頭銜。然而，秦始皇對此並不滿意。他隻采用一個“皇”字，因有“三皇五帝”而在其下加一“帝”字，創造出“皇帝”稱號。從此以後，“皇帝”就成為中國封建社會最高統治者的稱謂。為了使皇帝的地位神聖化，秦始皇又采取了一係列“尊君”的措施首先取消諡法。
諡法起於周初，是在君王死後，依其生平事跡，給予帶有評價性質的稱號。但秦始皇認為，像這樣“子議父，臣議君”，太不像話，更沒意義。他宣布廢除諡法，不準後代臣子評價自己。其次天子自稱曰“朕”。“朕”字的意義與“我”相同，以前一般人也可以使用，但秦始皇限定隻有皇帝才能自稱為“朕”。
皇帝的命令叫作“製”或“詔”（命曰製，令曰詔，蓋二者效令不同也）。第三，文字中不準提及皇帝的名字，要避諱。文件上逢“皇帝”“始皇帝”等字句時，都要另起一行頂格書寫。最後，隻限皇帝使用的、以玉質雕刻的大印才能稱為“璽”。
中央集權
秦始皇建立了中央集權製度和政權機構。中央設丞相、太尉、禦史大夫。丞相有左右二員，是百官之首，掌政事。太尉掌軍事，不常置。
禦史大夫是丞相的副貳，掌監察百官。丞相、太尉、禦史大夫以下，是分掌具體政務的諸卿，其中有掌宮殿掖門戶的郎中令，掌宮門衛屯兵的衛尉，掌京畿警衛的中尉，掌刑辟的廷尉，掌穀貨的治粟內史，掌山海池澤之稅和官府手工業製造以供應皇室的少府，掌治宮室的將作少府，掌國內民族事務和外事的典客，掌宗廟禮儀的奉常，掌皇室屬籍的宗正，掌輿馬的太仆等。丞相、太尉、禦史大夫與諸卿議論政務，皇帝作裁決。在此之外，秦代還有一些比較重要的官職，比如博士—“掌通古今”，即通曉古今史以備皇帝谘詢，同時負責圖書收藏；
典屬國——與典客一樣主管少數民族事務，不同的是典客掌管與秦友好的少數民族的交往，而典屬國則負責已投降秦朝的少數民族；
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詹事——管理皇後和太子的事務。秦王朝建立的這套中央集權機構的政權機構，以後一直被曆代王朝所仿效。
地方機構
秦始皇滅六國後，采納李斯的建議，廢除分封製，改行郡縣製。地方行政機構分郡、縣兩級。郡縣主要官吏由中央任免。郡設守、尉、監（監禦史）。郡守掌治其郡。郡尉輔佐郡守，並典兵事。郡監掌監察事宜。秦始皇把全國分成三十六郡，以後又陸續增設至四十一郡。
縣，萬戶以上者設令（縣令），萬戶以下者設長（縣長）。縣令、縣長領有縣丞、縣尉及其他屬員。縣令、縣長主要管政務，縣尉掌握軍事，縣丞掌管司法。
縣以下設鄉，其主要職能有四1攤派徭役；2征收田賦；3查證本鄉被告案情；4參與對國家倉庫糧食的保管工作。鄉設三老掌教化，嗇夫掌訴訟和賦稅，遊徼掌治安。鄉下設裡，是最基層的行政單位。裡有裡典，後代稱裡正、裡魁，以“豪帥”即強有力者為之。
裡中設置嚴密的什伍戶籍組織，以便支派差役，收納賦稅。並規定互相監督告奸，一人犯罪，鄰裡連坐。此外還有掌管治安、盜賊的專門機構，叫做亭，亭設亭長。亭除了主要管理治安，還負責接待往來的官吏，掌管為政府輸送、采購、傳遞（文書）等事。
軍事統一
六國韓國的實力在六國中最弱，但地理位置卻是秦國統一道路的最大障礙，秦始皇首選的攻擊目標為韓國。
始皇帝十六年（公元前231年），韓國南陽郡“假守”（即代理郡守）內史騰，向秦獻出他所管轄的屬地。內史騰被秦王政任命為內史，後又派他率軍進攻韓國。
內史騰於始皇帝十七年（公元前230年）俘獲韓王安，韓國滅亡。
始皇帝十八年（公元前229年），秦始皇派王翦領兵攻趙。趙國派李牧、司馬尚率兵抵禦。王翦用重金收買了趙王的寵臣郭開，要他散布李牧、司馬尚企圖謀反的流言。趙王輕信謠言，派趙蔥和顏聚替代李牧，此後李牧被殺害。
秦王政十九年（公元前228年），秦軍攻破邯鄲。不久，出逃的趙王遷被迫降秦，趙國實際上滅亡了。但是公子嘉卻帶著一夥人逃到代郡（河北蔚縣），自立為王。
後秦軍在始皇帝二十五年（公元前222年）滅燕國之後將其俘虜。
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