韋巨源，京兆萬年人，唐朝時期宰相，北周大司空韋孝寬玄孫。出身京兆韋氏鄖公房，以門蔭入仕，曆任司賓少卿、太府卿、文昌左丞、太子賓客、各部尚書。曾經四次拜相，官至左仆射，襲封舒國公，以宗親之誼，成為韋皇後的心腹。臨淄王李隆基發動唐隆政變，為亂兵所害，時年八十歲，唐睿宗複位後，念及教導和保護的功勞，追贈特進、荊州大都督，諡號為昭。
韋巨源，早年以門蔭入仕，在武周年間，曆任司賓少卿、司府卿。以文昌右丞之職拜相，加授同平章事，後改任兵部侍郎、同平章事。當時，內史李昭德獨攬朝政，韋巨源與豆盧欽望、陸元方、蘇味道、杜景儉雖同為宰相，但都依附李昭德，不敢糾正他的過失。李昭德罷相，韋巨源也被劾以“不能執正”、“罔上附下”之罪，貶為鄜州刺史，不久，韋巨源又被召回朝廷，擔任地官尚書。
由文昌左丞升任納言，第二次成為宰相，但又被罷為地官尚書，後來，武則天西幸長安，以韋巨源充任神都留守。韋巨源被召赴長安，改任刑部尚書，加領太子旦賓客。唐中宗複位，任命韋巨源為工部尚書，封同安縣子，韋巨源改任吏部尚書，加授同中書門下三品，第三次被拜為宰相，並進封郇縣伯。但他在相位僅兩個月，便因從叔韋安石拜相，又被罷為禮部尚書。
韋巨源在刑部尚書任上，被再授同中書門下三品，中宗命他和韋皇後敘宗親，進封舒國公，從此在朝中成為韋後黨羽。中宗婿光祿卿駙馬都尉王同皎，被控與洛陽人張仲之、祖延慶、武當丞周憬等謀反，計劃殺韋後情人、武則天侄德靜王武三思、廢韋後。張仲之被訊問時，說武三思罪狀，直稱武三思和韋後通奸，負責參驗其事的韋巨源，和另一結連韋後的宰相侍中楊再思假裝睡覺，不予理睬。
韋巨源為侍中、中書令，奉詔與唐休璟、李懷遠、祝欽明、蘇瑰等定《垂拱格》及《格後敕》，前後計二十卷，頒下施行。武三思先有實封數千戶在貝州，當時遇到大水，刺史宋璟請求免租庸及封丁，韋巨源卻以為莊稼雖然被淹沒，還有蠶桑業可輸租稅，於是河朔戶口頗多流散。
傳言韋後衣笥裙上有五色雲，是吉兆，韋巨源請公布天下，中宗從之，並大赦。當時星墜如雷、野雉同叫之類的凶兆，韋巨源卻不說，又見中宗昏惑，與左衛將軍同中書門下三品宗楚客、吏部尚書同平章事鄭愔、諫議大夫趙延禧等傳播妖言祥瑞，秘密引導韋後效法武則天。
韋巨源、楊再思分彆被任為左、右仆射，仍舊監修國史。中宗將祭祀長安南郊，國子祭酒祝欽明和國子司業郭山惲為奉承韋後，提議韋後為亞獻，而太常博士唐紹、蔣欽緒、國子司業鹽官褚無量則反對。韋巨源認可祝欽明所議，於是韋後為亞獻，祝欽明起初建議中宗有權勢的女兒安樂公主李裹兒為終獻，但唐紹、蔣欽緒堅決反對，中宗最終以韋巨源為終獻。中宗駕幸梨園毯場，命文武三品以上蹴鞠、拔河，韋巨源和同僚宰相太子少師、同中書門下三品唐休璟因年老摔倒在地，長久不能起來，中宗、皇後、皇妃、公主們看了，大笑。
中宗暴崩，傳統史家認為是韋後和李裹兒所毒殺，這樣韋後能如武則天一樣稱帝，李裹兒能成為皇太女，韋後立中宗庶子溫王李重茂為皇帝，即殤帝，本人作為攝政皇太後維持實權。不足一月，中宗妹太平公主和侄子臨淄王李隆基發動政變，殺韋太後、李裹兒。消息傳出，韋巨源家人建議其躲避，韋巨源答“我是大臣，有難豈能不赴？”出門到都街，被亂兵所殺。
不久，李隆基擁其父親，曾為皇帝的相王李旦複辟，即唐睿宗，睿宗追贈韋巨源特進、荊州大都督。太常博士李處直建議諡韋巨源為“昭”，戶部員外郎李邕堅決反對，說“武三思引薦他為宰相，韋後以他為宗親，無功受封，無德受祿。他誹謗同族韋安石，卻阿附外人宗楚客。諡號‘昭’是不合適的。”後來，又上了一篇更長的表文反對此諡，雖然世人同意，但睿宗仍然諡韋巨源為“昭”。
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